15028: Fixing 1.0 conformance tests
[arvados.git] / sdk / cwl / arvados_cwl / done.py
index 6d46e79cb84b33bee3af508c86498201aa37acd1..c0e3e0de2a70fb7d542af89fa53757b3126a04d1 100644 (file)
@@ -2,6 +2,8 @@
 #
 # SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
 
+from future.utils import viewvalues
+
 import re
 from cwltool.errors import WorkflowException
 from collections import deque
@@ -50,7 +52,7 @@ def done(self, record, tmpdir, outdir, keepdir):
 def done_outputs(self, record, tmpdir, outdir, keepdir):
     self.builder.outdir = outdir
     self.builder.pathmapper.keepdir = keepdir
-    return self.collect_outputs("keep:" + record["output"])
+    return self.collect_outputs("keep:" + record["output"], record["exit_code"])
 
 crunchstat_re = re.compile(r"^\d{4}-\d\d-\d\d_\d\d:\d\d:\d\d [a-z0-9]{5}-8i9sb-[a-z0-9]{15} \d+ \d+ stderr crunchstat:")
 timestamp_re = re.compile(r"^(\d{4}-\d\d-\d\dT\d\d:\d\d:\d\d\.\d+Z) (.*)")
@@ -63,7 +65,7 @@ def logtail(logcollection, logfunc, header, maxlen=25):
     containersapi = ("crunch-run.txt" in logcollection)
     mergelogs = {}
 
-    for log in logcollection.keys():
+    for log in list(logcollection):
         if not containersapi or log in ("crunch-run.txt", "stdout.txt", "stderr.txt"):
             logname = log[:-4]
             logt = deque([], maxlen)
@@ -77,7 +79,7 @@ def logtail(logcollection, logfunc, header, maxlen=25):
                         logt.append(l)
 
     if containersapi:
-        keys = mergelogs.keys()
+        keys = list(mergelogs)
         loglines = []
         while True:
             earliest = None
@@ -91,7 +93,7 @@ def logtail(logcollection, logfunc, header, maxlen=25):
             loglines.append("%s %s %s" % (ts, earliest, msg))
         loglines = loglines[-maxlen:]
     else:
-        loglines = mergelogs.values()[0]
+        loglines = mergelogs[list(mergelogs)[0]]
 
     logtxt = "\n  ".join(l.strip() for l in loglines)
     logfunc("%s\n\n  %s", header, logtxt)