16347: Add test case. Flush keepstore logs in CommitLogs.
[arvados.git] / lib / crunchrun / integration_test.go
index c688248c64fbdc26330144ebeafb3abf8c42edc6..597490c5788d6a3ddf0e351023d81f8413baef62 100644 (file)
@@ -6,6 +6,7 @@ package crunchrun
 
 import (
        "bytes"
+       "encoding/json"
        "fmt"
        "io"
        "io/ioutil"
@@ -13,9 +14,11 @@ import (
        "os/exec"
        "strings"
 
+       "git.arvados.org/arvados.git/lib/config"
        "git.arvados.org/arvados.git/sdk/go/arvados"
        "git.arvados.org/arvados.git/sdk/go/arvadosclient"
        "git.arvados.org/arvados.git/sdk/go/arvadostest"
+       "git.arvados.org/arvados.git/sdk/go/ctxlog"
        "git.arvados.org/arvados.git/sdk/go/keepclient"
        . "gopkg.in/check.v1"
 )
@@ -33,6 +36,9 @@ type integrationSuite struct {
        client *arvados.Client
        ac     *arvadosclient.ArvadosClient
        kc     *keepclient.KeepClient
+
+       logCollection    arvados.Collection
+       outputCollection arvados.Collection
 }
 
 func (s *integrationSuite) SetUpSuite(c *C) {
@@ -49,7 +55,12 @@ func (s *integrationSuite) SetUpSuite(c *C) {
        out, err = exec.Command("arv-keepdocker", "--no-resume", "busybox:uclibc").Output()
        imageUUID := strings.TrimSpace(string(out))
        c.Logf("image uuid %s", imageUUID)
-       c.Assert(err, IsNil)
+       if !c.Check(err, IsNil) {
+               if err, ok := err.(*exec.ExitError); ok {
+                       c.Logf("%s", err.Stderr)
+               }
+               c.Fail()
+       }
        err = arvados.NewClientFromEnv().RequestAndDecode(&s.image, "GET", "arvados/v1/collections/"+imageUUID, nil, nil)
        c.Assert(err, IsNil)
        c.Logf("image pdh %s", s.image.PortableDataHash)
@@ -76,6 +87,9 @@ func (s *integrationSuite) SetUpSuite(c *C) {
        })
        c.Assert(err, IsNil)
        c.Logf("input pdh %s", s.input.PortableDataHash)
+
+       s.logCollection = arvados.Collection{}
+       s.outputCollection = arvados.Collection{}
 }
 
 func (s *integrationSuite) TearDownSuite(c *C) {
@@ -150,17 +164,56 @@ func (s *integrationSuite) TestRunTrivialContainerWithSingularity(c *C) {
        s.testRunTrivialContainer(c)
 }
 
+func (s *integrationSuite) TestRunTrivialContainerWithLocalKeepstore(c *C) {
+       cfg, err := config.NewLoader(nil, ctxlog.TestLogger(c)).Load()
+       c.Assert(err, IsNil)
+       cluster, err := cfg.GetCluster("")
+       c.Assert(err, IsNil)
+       for uuid, volume := range cluster.Volumes {
+               volume.AccessViaHosts = nil
+               volume.Replication = 2
+               cluster.Volumes[uuid] = volume
+       }
+
+       s.stdin.Reset()
+       err = json.NewEncoder(&s.stdin).Encode(ConfigData{
+               Env:         nil,
+               KeepBuffers: 1,
+               Cluster:     cluster,
+       })
+       c.Assert(err, IsNil)
+
+       s.engine = "docker"
+       s.testRunTrivialContainer(c)
+
+       fs, err := s.logCollection.FileSystem(s.client, s.kc)
+       c.Assert(err, IsNil)
+       f, err := fs.Open("keepstore.txt")
+       c.Assert(err, IsNil)
+       buf, err := ioutil.ReadAll(f)
+       c.Assert(err, IsNil)
+       c.Check(string(buf), Matches, `(?ms).*"reqMethod":"GET".*`)
+       c.Check(string(buf), Matches, `(?ms).*"reqMethod":"PUT".*,"reqPath":"0e3bcff26d51c895a60ea0d4585e134d".*`)
+}
+
 func (s *integrationSuite) testRunTrivialContainer(c *C) {
        if err := exec.Command("which", s.engine).Run(); err != nil {
                c.Skip(fmt.Sprintf("%s: %s", s.engine, err))
        }
        s.cr.Command = []string{"sh", "-c", "cat /mnt/in/inputfile >/mnt/out/inputfile && cat /mnt/json >/mnt/out/json && ! touch /mnt/in/shouldbereadonly && mkdir /mnt/out/emptydir"}
        s.setup(c)
-       code := command{}.RunCommand("crunch-run", []string{
+
+       args := []string{
                "-runtime-engine=" + s.engine,
                "-enable-memory-limit=false",
                s.cr.ContainerUUID,
-       }, &s.stdin, io.MultiWriter(&s.stdout, os.Stderr), io.MultiWriter(&s.stderr, os.Stderr))
+       }
+       if s.stdin.Len() > 0 {
+               args = append([]string{"-stdin-config=true"}, args...)
+       }
+       code := command{}.RunCommand("crunch-run", args, &s.stdin, io.MultiWriter(&s.stdout, os.Stderr), io.MultiWriter(&s.stderr, os.Stderr))
+       c.Logf("\n===== stdout =====\n%s", s.stdout.String())
+       c.Logf("\n===== stderr =====\n%s", s.stderr.String())
        c.Check(code, Equals, 0)
        err := s.client.RequestAndDecode(&s.cr, "GET", "arvados/v1/container_requests/"+s.cr.UUID, nil, nil)
        c.Assert(err, IsNil)
@@ -185,6 +238,7 @@ func (s *integrationSuite) testRunTrivialContainer(c *C) {
                        c.Logf("\n===== %s =====\n%s", fi.Name(), buf)
                }
        }
+       s.logCollection = log
 
        var output arvados.Collection
        err = s.client.RequestAndDecode(&output, "GET", "arvados/v1/collections/"+s.cr.OutputUUID, nil, nil)
@@ -218,4 +272,5 @@ func (s *integrationSuite) testRunTrivialContainer(c *C) {
                        c.Check(fi.Name(), Equals, ".keep")
                }
        }
+       s.outputCollection = output
 }