Merge branch '5030-hide-graph-until-data' closes #5030
[arvados.git] / doc / user / topics / tutorial-gatk-variantfiltration.html.textile.liquid
index ea608b4bc1c15a278f919abe8f8677e943f39b8c..fa33f67669259dbdd820517264f06ae54678b7a7 100644 (file)
@@ -6,7 +6,7 @@ title: "Using GATK with Arvados"
 
 This tutorial demonstrates how to use the Genome Analysis Toolkit (GATK) with Arvados. In this example we will install GATK and then create a VariantFiltration job to assign pass/fail scores to variants in a VCF file.
 
-*This tutorial assumes that you are "logged into an Arvados VM instance":{{site.baseurl}}/user/getting_started/ssh-access.html#login, and have a "working environment.":{{site.baseurl}}/user/getting_started/check-environment.html*
+{% include 'tutorial_expectations' %}
 
 h2. Installing GATK