if result.group(2) != None:
p[1]["reader"] = s.files()[result.group(1) + "_2.fastq" + result.group(2)]
else:
- p[1]["reader"] = s.files()[result.group(1) + "_2.fastq"
+ p[1]["reader"] = s.files()[result.group(1) + "_2.fastq"]
splitfastq(p)
#m0 = p[0]["reader"].as_manifest()[1:]
#m1 = p[1]["reader"].as_manifest()[1:]