Merge branch 'thehyve/fix-crunch-documentation' Fix a typo in Crunch Dispatch install...
[arvados.git] / services / keepstore / s3_volume.go
index 0ab3e969a0ebaa3f0d007e0c764a1e7507f6ec8a..9d4d8019282ebf01160544d940345b36fe892076 100644 (file)
@@ -18,12 +18,12 @@ import (
        "regexp"
        "strings"
        "sync"
+       "sync/atomic"
        "time"
 
        "git.curoverse.com/arvados.git/sdk/go/arvados"
        "github.com/AdRoll/goamz/aws"
        "github.com/AdRoll/goamz/s3"
-       log "github.com/Sirupsen/logrus"
 )
 
 const (
@@ -45,6 +45,8 @@ var (
        s3RaceWindow    time.Duration
 
        s3ACL = s3.Private
+
+       zeroTime time.Time
 )
 
 const (
@@ -151,6 +153,7 @@ type S3Volume struct {
        RaceWindow         arvados.Duration
        ReadOnly           bool
        UnsafeDelete       bool
+       StorageClasses     []string
 
        bucket *s3bucket
 
@@ -340,6 +343,40 @@ func (v *S3Volume) Get(ctx context.Context, loc string, buf []byte) (int, error)
 
 // Compare the given data with the stored data.
 func (v *S3Volume) Compare(ctx context.Context, loc string, expect []byte) error {
+       errChan := make(chan error, 1)
+       go func() {
+               _, err := v.bucket.Head("recent/"+loc, nil)
+               errChan <- err
+       }()
+       var err error
+       select {
+       case <-ctx.Done():
+               return ctx.Err()
+       case err = <-errChan:
+       }
+       if err != nil {
+               // Checking for "loc" itself here would interfere with
+               // future GET requests.
+               //
+               // On AWS, if X doesn't exist, a HEAD or GET request
+               // for X causes X's non-existence to be cached. Thus,
+               // if we test for X, then create X and return a
+               // signature to our client, the client might still get
+               // 404 from all keepstores when trying to read it.
+               //
+               // To avoid this, we avoid doing HEAD X or GET X until
+               // we know X has been written.
+               //
+               // Note that X might exist even though recent/X
+               // doesn't: for example, the response to HEAD recent/X
+               // might itself come from a stale cache. In such
+               // cases, we will return a false negative and
+               // PutHandler might needlessly create another replica
+               // on a different volume. That's not ideal, but it's
+               // better than passing the eventually-consistent
+               // problem on to our clients.
+               return v.translateError(err)
+       }
        rdr, err := v.getReaderWithContext(ctx, loc)
        if err != nil {
                return err
@@ -386,7 +423,7 @@ func (v *S3Volume) Put(ctx context.Context, loc string, block []byte) error {
                if err != nil {
                        return
                }
-               err = v.bucket.Put("recent/"+loc, nil, "application/octet-stream", s3ACL, s3.Options{})
+               err = v.bucket.PutReader("recent/"+loc, nil, 0, "application/octet-stream", s3ACL, s3.Options{})
        }()
        select {
        case <-ctx.Done():
@@ -418,7 +455,7 @@ func (v *S3Volume) Touch(loc string) error {
        } else if err != nil {
                return err
        }
-       err = v.bucket.Put("recent/"+loc, nil, "application/octet-stream", s3ACL, s3.Options{})
+       err = v.bucket.PutReader("recent/"+loc, nil, 0, "application/octet-stream", s3ACL, s3.Options{})
        return v.translateError(err)
 }
 
@@ -432,7 +469,7 @@ func (v *S3Volume) Mtime(loc string) (time.Time, error) {
        err = v.translateError(err)
        if os.IsNotExist(err) {
                // The data object X exists, but recent/X is missing.
-               err = v.bucket.Put("recent/"+loc, nil, "application/octet-stream", s3ACL, s3.Options{})
+               err = v.bucket.PutReader("recent/"+loc, nil, 0, "application/octet-stream", s3ACL, s3.Options{})
                if err != nil {
                        log.Printf("error: creating %q: %s", "recent/"+loc, err)
                        return zeroTime, v.translateError(err)
@@ -614,7 +651,7 @@ func (v *S3Volume) Untrash(loc string) error {
        if err != nil {
                return err
        }
-       err = v.bucket.Put("recent/"+loc, nil, "application/octet-stream", s3ACL, s3.Options{})
+       err = v.bucket.PutReader("recent/"+loc, nil, 0, "application/octet-stream", s3ACL, s3.Options{})
        return v.translateError(err)
 }
 
@@ -651,6 +688,11 @@ func (v *S3Volume) Replication() int {
        return v.S3Replication
 }
 
+// GetStorageClasses implements Volume
+func (v *S3Volume) GetStorageClasses() []string {
+       return v.StorageClasses
+}
+
 var s3KeepBlockRegexp = regexp.MustCompile(`^[0-9a-f]{32}$`)
 
 func (v *S3Volume) isKeepBlock(s string) bool {
@@ -723,26 +765,21 @@ func (v *S3Volume) translateError(err error) error {
 func (v *S3Volume) EmptyTrash() {
        var bytesInTrash, blocksInTrash, bytesDeleted, blocksDeleted int64
 
-       // Use a merge sort to find matching sets of trash/X and recent/X.
-       trashL := s3Lister{
-               Bucket:   v.bucket.Bucket,
-               Prefix:   "trash/",
-               PageSize: v.IndexPageSize,
-       }
        // Define "ready to delete" as "...when EmptyTrash started".
        startT := time.Now()
-       for trash := trashL.First(); trash != nil; trash = trashL.Next() {
+
+       emptyOneKey := func(trash *s3.Key) {
                loc := trash.Key[6:]
                if !v.isKeepBlock(loc) {
-                       continue
+                       return
                }
-               bytesInTrash += trash.Size
-               blocksInTrash++
+               atomic.AddInt64(&bytesInTrash, trash.Size)
+               atomic.AddInt64(&blocksInTrash, 1)
 
                trashT, err := time.Parse(time.RFC3339, trash.LastModified)
                if err != nil {
                        log.Printf("warning: %s: EmptyTrash: %q: parse %q: %s", v, trash.Key, trash.LastModified, err)
-                       continue
+                       return
                }
                recent, err := v.bucket.Head("recent/"+loc, nil)
                if err != nil && os.IsNotExist(v.translateError(err)) {
@@ -751,15 +788,15 @@ func (v *S3Volume) EmptyTrash() {
                        if err != nil {
                                log.Printf("error: %s: EmptyTrash: Untrash(%q): %s", v, loc, err)
                        }
-                       continue
+                       return
                } else if err != nil {
                        log.Printf("warning: %s: EmptyTrash: HEAD %q: %s", v, "recent/"+loc, err)
-                       continue
+                       return
                }
                recentT, err := v.lastModified(recent)
                if err != nil {
                        log.Printf("warning: %s: EmptyTrash: %q: parse %q: %s", v, "recent/"+loc, recent.Header.Get("Last-Modified"), err)
-                       continue
+                       return
                }
                if trashT.Sub(recentT) < theConfig.BlobSignatureTTL.Duration() {
                        if age := startT.Sub(recentT); age >= theConfig.BlobSignatureTTL.Duration()-time.Duration(v.RaceWindow) {
@@ -774,39 +811,67 @@ func (v *S3Volume) EmptyTrash() {
                                log.Printf("notice: %s: EmptyTrash: detected old race for %q, calling fixRace + Touch", v, loc)
                                v.fixRace(loc)
                                v.Touch(loc)
-                               continue
+                               return
                        }
                        _, err := v.bucket.Head(loc, nil)
                        if os.IsNotExist(err) {
                                log.Printf("notice: %s: EmptyTrash: detected recent race for %q, calling fixRace", v, loc)
                                v.fixRace(loc)
-                               continue
+                               return
                        } else if err != nil {
                                log.Printf("warning: %s: EmptyTrash: HEAD %q: %s", v, loc, err)
-                               continue
+                               return
                        }
                }
                if startT.Sub(trashT) < theConfig.TrashLifetime.Duration() {
-                       continue
+                       return
                }
                err = v.bucket.Del(trash.Key)
                if err != nil {
                        log.Printf("warning: %s: EmptyTrash: deleting %q: %s", v, trash.Key, err)
-                       continue
+                       return
                }
-               bytesDeleted += trash.Size
-               blocksDeleted++
+               atomic.AddInt64(&bytesDeleted, trash.Size)
+               atomic.AddInt64(&blocksDeleted, 1)
 
                _, err = v.bucket.Head(loc, nil)
-               if os.IsNotExist(err) {
-                       err = v.bucket.Del("recent/" + loc)
-                       if err != nil {
-                               log.Printf("warning: %s: EmptyTrash: deleting %q: %s", v, "recent/"+loc, err)
-                       }
-               } else if err != nil {
-                       log.Printf("warning: %s: EmptyTrash: HEAD %q: %s", v, "recent/"+loc, err)
+               if err == nil {
+                       log.Printf("warning: %s: EmptyTrash: HEAD %q succeeded immediately after deleting %q", v, loc, loc)
+                       return
                }
+               if !os.IsNotExist(v.translateError(err)) {
+                       log.Printf("warning: %s: EmptyTrash: HEAD %q: %s", v, loc, err)
+                       return
+               }
+               err = v.bucket.Del("recent/" + loc)
+               if err != nil {
+                       log.Printf("warning: %s: EmptyTrash: deleting %q: %s", v, "recent/"+loc, err)
+               }
+       }
+
+       var wg sync.WaitGroup
+       todo := make(chan *s3.Key, theConfig.EmptyTrashWorkers)
+       for i := 0; i < 1 || i < theConfig.EmptyTrashWorkers; i++ {
+               wg.Add(1)
+               go func() {
+                       defer wg.Done()
+                       for key := range todo {
+                               emptyOneKey(key)
+                       }
+               }()
+       }
+
+       trashL := s3Lister{
+               Bucket:   v.bucket.Bucket,
+               Prefix:   "trash/",
+               PageSize: v.IndexPageSize,
+       }
+       for trash := trashL.First(); trash != nil; trash = trashL.Next() {
+               todo <- trash
        }
+       close(todo)
+       wg.Wait()
+
        if err := trashL.Error(); err != nil {
                log.Printf("error: %s: EmptyTrash: lister: %s", v, err)
        }
@@ -893,14 +958,18 @@ func (b *s3bucket) Head(path string, headers map[string][]string) (*http.Respons
 }
 
 func (b *s3bucket) PutReader(path string, r io.Reader, length int64, contType string, perm s3.ACL, options s3.Options) error {
-       err := b.Bucket.PutReader(path, NewCountingReader(r, b.stats.TickOutBytes), length, contType, perm, options)
-       b.stats.Tick(&b.stats.Ops, &b.stats.PutOps)
-       b.stats.TickErr(err)
-       return err
-}
-
-func (b *s3bucket) Put(path string, data []byte, contType string, perm s3.ACL, options s3.Options) error {
-       err := b.Bucket.PutReader(path, NewCountingReader(bytes.NewBuffer(data), b.stats.TickOutBytes), int64(len(data)), contType, perm, options)
+       if length == 0 {
+               // goamz will only send Content-Length: 0 when reader
+               // is nil due to net.http.Request.ContentLength
+               // behavior.  Otherwise, Content-Length header is
+               // omitted which will cause some S3 services
+               // (including AWS and Ceph RadosGW) to fail to create
+               // empty objects.
+               r = nil
+       } else {
+               r = NewCountingReader(r, b.stats.TickOutBytes)
+       }
+       err := b.Bucket.PutReader(path, r, length, contType, perm, options)
        b.stats.Tick(&b.stats.Ops, &b.stats.PutOps)
        b.stats.TickErr(err)
        return err