14874: Fixes 'the the' typos on documentation & code comments.
[arvados.git] / doc / user / topics / arv-run.html.textile.liquid
index 93fc2c0f34e4a3da4388560b265d7c189da30fa3..9752ca7d2b49d1afb077f63d652a2c2835ce2d37 100644 (file)
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 navsection: userguide
 title: "Using arv-run"
 ...
+{% comment %}
+Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
+
+SPDX-License-Identifier: CC-BY-SA-3.0
+{% endcomment %}
 
 {% include 'crunch1only_begin' %}
 On those sites, the features described here are not yet implemented.
@@ -141,7 +146,7 @@ h2. Additional options
 * @--docker-image IMG@ : By default, commands run based in a container created from the @default_docker_image_for_jobs@ setting on the API server.  Use this option to specify a different image to use.  Note: the Docker image must be uploaded to Arvados using @arv keep docker@.
 * @--dry-run@ : Print out the final Arvados pipeline generated by @arv-run@ without submitting it.
 * @--local@ : By default, the pipeline will be submitted to your configured Arvados instance.  Use this option to run the command locally using @arv-run-pipeline-instance --run-jobs-here@.
-* @--ignore-rcode@ : Some commands use non-zero exit codes to indicate nonfatal conditions (e.g. @grep@ returns 1 when no match is found).  Set this to indicate that commands that return non-zero return codes should not be considered failed.
+* @--ignore-rcode@ : Some commands use non-zero exit codes to indicate nonfatal conditions (e.g., @grep@ returns 1 when no match is found).  Set this to indicate that commands that return non-zero return codes should not be considered failed.
 * @--no-wait@ : Do not wait and display logs after submitting command, just exit.
 
 h2. Putting it all together: bwa mem