docker/compute/Dockerfile

   1 # Arvados compute node Docker container.
   2
   3 FROM arvados/slurm
   4 MAINTAINER Ward Vandewege <ward@curoverse.com>
   5
   6 ADD apt.arvados.org.list /etc/apt/sources.list.d/
   7 RUN apt-key adv --keyserver pgp.mit.edu --recv 1078ECD7
   8
   9 RUN apt-get update && apt-get -qqy install supervisor python-pip python-pyvcf python-gflags python-google-api-python-client python-virtualenv libattr1-dev libfuse-dev python-dev python-llfuse fuse crunchstat python-arvados-python-client python-arvados-fuse cron
  10
  11 ADD fuse.conf /etc/fuse.conf
  12
  13 RUN /usr/local/rvm/bin/rvm-exec default gem install arvados-cli arvados
  14
  15 # Install Docker from the Docker Inc. repository
  16 RUN apt-get update -qq && apt-get install -qqy iptables ca-certificates lxc apt-transport-https
  17 RUN echo deb https://get.docker.io/ubuntu docker main > /etc/apt/sources.list.d/docker.list
  18 RUN apt-key adv --keyserver hkp://keyserver.ubuntu.com:80 --recv-keys 36A1D7869245C8950F966E92D8576A8BA88D21E9
  19 RUN apt-get update -qq && apt-get install -qqy lxc-docker
  20
  21 RUN addgroup --gid 4005 crunch && mkdir /home/crunch && useradd --uid 4005 --gid 4005 crunch && usermod crunch -G fuse,docker && chown crunch:crunch /home/crunch
  22
  23 # Fix /dev/fuse permissions/ownership
  24 RUN chmod 1660 /dev/fuse && chgrp fuse /dev/fuse
  25
  26 # Supervisor.
  27 ADD supervisor.conf /etc/supervisor/conf.d/arvados.conf
  28 ADD ssh.sh /usr/local/bin/ssh.sh
  29 ADD generated/setup.sh /usr/local/bin/setup.sh
  30 ADD wrapdocker /usr/local/bin/wrapdocker.sh
  31
  32 VOLUME /var/lib/docker
  33 # Start the supervisor.
  34 CMD ["/usr/bin/supervisord", "-n"]