app/views/collections/show.html.erb

   1 <%= content_for :head do %>
   2 <style>
   3 <%# https://github.com/mbostock/d3/wiki/Ordinal-Scales %>
   4 <% n=-1; %w(#1f77b4 #ff7f0e #2ca02c #d62728 #9467bd #8c564b #e377c2 #7f7f7f #bcbd22 #17becf).each do |color| %>
   5 .colorseries-10-<%= n += 1 %>, .btn.colorseries-10-<%= n %>:hover {
   6   *background-color: <%= color %>;
   7   background-color: <%= color %>;
   8   background-image: none;
   9 }
  10 <% end %>
  11 .colorseries-nil { background-color: white }
  12 </style>
  13 <% end %>
  14
  15 <%= render :partial => 'nav' %>
  16
  17 <ul class="nav nav-tabs">
  18   <li class="active"><a href="#files" data-toggle="tab">Files (<%= @object.files ? @object.files.size : 0 %>)</a></li>
  19   <li><a href="#provenance" data-toggle="tab">Provenance (<%= @provenance.size %>)</a></li>
  20   <li><a href="#jobs" data-toggle="tab">Jobs (<%= @provenance.size %>)</a></li>
  21   <li><a href="#sourcedata" data-toggle="tab">Source data (<%= @sourcedata.size %>)</a></li>
  22 </ul>
  23
  24 <div class="tab-content">
  25   <div id="files" class="tab-pane fade in active">
  26     <table class="table table-bordered">
  27       <thead>
  28         <tr><th style="text-align:right">size (bytes)</th><th>filename</th></tr>
  29       </thead><tbody>
  30         <% if @object then @object.files.each do |file| %>
  31         <tr>
  32           <td style="text-align:right">
  33             <%= raw(human_readable_bytes_html(file[2])) %>
  34           </td><td>
  35             <%= file[0] %>/<%= file[1] %>
  36           </td>
  37         </tr>
  38         <% end; end %>
  39       </tbody>
  40     </table>
  41   </div>
  42   <div id="provenance" class="tab-pane fade">
  43     <table class="topalign table table-bordered">
  44       <thead>
  45       </thead>
  46       <tbody>
  47
  48         <% @provenance.reverse.each do |p| %>
  49         <% j = p[:job] %>
  50
  51         <% if j %>
  52
  53         <tr class="job">
  54           <td style="padding-bottom: 3em">
  55             <table class="table" style="margin-bottom: 0; background: #f0f0ff">
  56               <% j.script_parameters.each do |k,v| %>
  57               <tr>
  58                 <td style="width: 60%">
  59                   <% re = v.match(/^([0-9a-f]+)/) %>
  60                   <% justhash = (re and re[1].length == 32) ? re[1] : nil %>
  61                   <% if justhash and @output2job.has_key? justhash %>
  62                   <tt class="btn colorseries-10-<%= @output2colorindex[v] %> deemphasize"><%= v %></tt>
  63                   <% elsif justhash %>
  64                   <tt class="btn colorseries-nil deemphasize"><%= justhash %></tt><br /><span class="deemphasize"><%= v %></span>
  65                   <% else %>
  66                   <span class="deemphasize"><%= v %></span>
  67                   <% end %>
  68                 </td><td style="text-align: center; width: 20%">
  69                   <% if justhash
  70                        if @protected[justhash]
  71                          btnclass = 'success'
  72                          btntext = 'keep'
  73                        else
  74                          btnclass = @output2job.has_key?(v) ? 'warning' : 'danger'
  75                          btntext = 'cache'
  76                        end %>
  77
  78                   <tt class="btn btn-<%= btnclass %> deemphasize"><%= btntext %></tt>
  79                   <% end %>
  80                 </td><td style="width: 20%">
  81                   <%= k.to_s %>
  82                 </td>
  83               </tr>
  84               <% end %>
  85             </table>
  86             <div style="text-align: center">
  87               &darr;
  88               <br />
  89               <span class="btn deemphasize"><%= j.script %><br /><tt><%= link_to_if j.script_version.match(/[0-9a-f]{40}/), j.script_version, "https://redmine.clinicalfuture.com/projects/freefactories/repository/revisions/#{j.script_version}/entry/mapreduce/mr-#{j.script}" if j.script_version %></tt></span>
  90               <br />
  91               &darr;
  92               <br />
  93               <tt class="btn colorseries-10-<%= @output2colorindex[p[:output]] %> deemphasize"><%= p[:output] %></tt>
  94             </div>
  95           </td>
  96           <td>
  97             <tt><span class="deemphasize">job:</span><br /><%= j.uuid %><br /><span class="deemphasize"><%= j.submit_id %></span></tt>
  98           </td>
  99         </tr>
 100
 101         <% else %>
 102         <tr>
 103           <td>
 104             <span class="btn btn-danger">lookup fail</span>
 105             <br />
 106             <tt class="deemphasize"><%= p[:target] %></tt>
 107           </td><td colspan="4">
 108           </td>
 109         </tr>
 110         <% end %>
 111
 112         <% end %>
 113
 114       </tbody>
 115     </table>
 116   </div>
 117   <div id="jobs" class="tab-pane fade">
 118     <table class="topalign table table-bordered">
 119       <thead>
 120         <tr class="contain-align-left">
 121           <th>
 122             job
 123           </th><th>
 124             version
 125           </th><th>
 126             status
 127           </th><th>
 128             start
 129           </th><th>
 130             finish
 131           </th><th>
 132             clock time
 133           </th>
 134         </tr>
 135       </thead>
 136       <tbody>
 137
 138         <% @provenance.reverse.each do |p| %>
 139         <% j = p[:job] %>
 140
 141         <% if j %>
 142
 143         <tr class="job">
 144           <td>
 145             <tt><%= j.uuid %></tt>
 146             <br />
 147             <tt class="deemphasize"><%= j.submit_id %></tt>
 148           </td><td>
 149             <%= j.script_version %>
 150           </td><td>
 151             <span class="btn <%= if j.success then 'btn-success'; elsif j.active then 'btn-primary'; else 'btn-warning'; end %>">
 152               <%= j.success || j.active ? 'ok' : 'failed' %>
 153             </span>
 154           </td><td>
 155             <%= j.started_at %>
 156           </td><td>
 157             <%= j.finished_at %>
 158           </td><td>
 159             <% if j.started_at and j.finished_at %>
 160             <%= raw(distance_of_time_in_words(j.started_at, j.finished_at).sub('about ','~').sub(' ','&nbsp;')) %>
 161             <% elsif j.started_at and j.running %>
 162             <%= raw(distance_of_time_in_words(j.started_at, Time.now).sub('about ','~').sub(' ','&nbsp;')) %> (running)
 163             <% end %>
 164           </td>
 165         </tr>
 166
 167         <% else %>
 168         <tr>
 169           <td>
 170             <span class="btn btn-danger">lookup fail</span>
 171             <br />
 172             <tt class="deemphasize"><%= p[:target] %></tt>
 173           </td><td colspan="4">
 174           </td>
 175         </tr>
 176         <% end %>
 177
 178         <% end %>
 179
 180       </tbody>
 181     </table>
 182   </div>
 183   <div id="sourcedata" class="tab-pane fade">
 184     <table class="table table-bordered table-striped">
 185       <thead>
 186         <tr class="contain-align-left">
 187           <th>
 188             collection
 189           </th><th class="data-size">
 190             data size
 191           </th><th>
 192             storage
 193           </th><th>
 194             origin
 195           </th>
 196         </tr>
 197       </thead>
 198       <tbody>
 199
 200         <% @sourcedata.values.each do |sourcedata| %>
 201
 202         <tr class="collection">
 203           <td>
 204             <span class="btn"><tt class="deemphasize"><%= sourcedata[:uuid] %></tt></span>
 205           </td><td class="data-size">
 206             <%= raw(human_readable_bytes_html(sourcedata[:collection].data_size)) if sourcedata[:collection] and sourcedata[:collection].data_size %>
 207           </td><td>
 208             <% if @protected[sourcedata[:uuid]] %>
 209             <span class="btn btn-success">keep</span>
 210             <% else %>
 211             <span class="btn btn-danger">cache</span>
 212             <% end %>
 213           </td><td>
 214             <% if sourcedata[:data_origins] %>
 215             <% sourcedata[:data_origins].each do |data_origin| %>
 216             <span class="deemphasize"><%= data_origin[0] %></span>
 217             <%= data_origin[2] %>
 218             <br />
 219             <% end %>
 220             <% end %>
 221           </td>
 222         </tr>
 223
 224         <% end %>
 225
 226       </tbody>
 227     </table>
 228   </div>
 229 </div>