build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/libcloud-pin.sh
   7
   8 COLUMNS=80
   9 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
  10
  11 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  12 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  13
  14 Exit non-zero if any tests fail.
  15
  16 Syntax:
  17         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  18
  19 Options:
  20
  21 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  22 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  23 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  24                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  25                from a previous invocation if you use this option.
  26 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  27 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  28                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  29 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  30                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  31                subsequent invocations.
  32 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  33 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  34 --only-install Run specific install step
  35 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  36 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  37 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  38 CONFIGSRC=path Dir with config.yml file containing PostgreSQL section for use by tests.
  39 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  40                Restrict apiserver tests to the given file
  41 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  42                Restrict Python SDK tests to the given class
  43 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  44                Restrict Workbench tests to the given file
  45 services/arv-git-httpd_test="-check.vv"
  46                Show all log messages, even when tests pass (also works
  47                with services/keepstore_test etc.)
  48 ARVADOS_DEBUG=1
  49                Print more debug messages
  50 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  51                *_test, and other examples shown above.
  52
  53 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  54 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  55 test suites depend on other components being installed, and installing
  56 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  57
  58 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  59 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  60
  61 More information and background:
  62
  63 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  64
  65 Available tests:
  66
  67 apps/workbench (*)
  68 apps/workbench_units (*)
  69 apps/workbench_functionals (*)
  70 apps/workbench_integration (*)
  71 apps/workbench_benchmark
  72 apps/workbench_profile
  73 cmd/arvados-client
  74 cmd/arvados-server
  75 doc
  76 lib/cli
  77 lib/cmd
  78 lib/controller
  79 lib/controller/federation
  80 lib/controller/railsproxy
  81 lib/controller/router
  82 lib/controller/rpc
  83 lib/crunchstat
  84 lib/crunch-run
  85 lib/cloud
  86 lib/cloud/azure
  87 lib/cloud/cloudtest
  88 lib/dispatchcloud
  89 lib/dispatchcloud/container
  90 lib/dispatchcloud/scheduler
  91 lib/dispatchcloud/ssh_executor
  92 lib/dispatchcloud/worker
  93 lib/mount
  94 lib/service
  95 services/api
  96 services/arv-git-httpd
  97 services/crunchstat
  98 services/dockercleaner
  99 services/fuse
 100 services/fuse:py3
 101 services/health
 102 services/keep-web
 103 services/keepproxy
 104 services/keepstore
 105 services/keep-balance
 106 services/login-sync
 107 services/nodemanager
 108 services/nodemanager_integration
 109 services/crunch-dispatch-local
 110 services/crunch-dispatch-slurm
 111 services/ws
 112 sdk/cli
 113 sdk/pam
 114 sdk/pam:py3
 115 sdk/python
 116 sdk/python:py3
 117 sdk/ruby
 118 sdk/go/arvados
 119 sdk/go/arvadosclient
 120 sdk/go/auth
 121 sdk/go/dispatch
 122 sdk/go/keepclient
 123 sdk/go/health
 124 sdk/go/httpserver
 125 sdk/go/manifest
 126 sdk/go/blockdigest
 127 sdk/go/asyncbuf
 128 sdk/go/stats
 129 sdk/go/crunchrunner
 130 sdk/cwl:py3
 131 sdk/R
 132 sdk/java-v2
 133 tools/sync-groups
 134 tools/crunchstat-summary
 135 tools/crunchstat-summary:py3
 136 tools/keep-exercise
 137 tools/keep-rsync
 138 tools/keep-block-check
 139
 140 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 141     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 142
 143 EOF
 144
 145 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 146 # environment that could interfere with the tests.
 147 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 148
 149 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 150 # accident.
 151 GITDIR=
 152 GOPATH=
 153 VENVDIR=
 154 VENV3DIR=
 155 PYTHONPATH=
 156 GEMHOME=
 157 PERLINSTALLBASE=
 158 R_LIBS=
 159 export LANG=en_US.UTF-8
 160
 161 short=
 162 only_install=
 163 temp=
 164 temp_preserve=
 165
 166 clear_temp() {
 167     if [[ -z "$temp" ]]; then
 168         # we didn't even get as far as making a temp dir
 169         :
 170     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 171         rm -rf "$temp"
 172     else
 173         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 174     fi
 175 }
 176
 177 fatal() {
 178     clear_temp
 179     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 180     exit 1
 181 }
 182
 183 exit_cleanly() {
 184     trap - INT
 185     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 186         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 187     fi
 188     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 189     stop_services
 190     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 191     report_outcomes
 192     clear_temp
 193     exit ${#failures}
 194 }
 195
 196 sanity_checks() {
 197     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 198     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 199         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 200     [[ -z "$CONFIGSRC" ]] || [[ -s "$CONFIGSRC/config.yml" ]] \
 201         || fatal "CONFIGSRC is $CONFIGSRC but '$CONFIGSRC/config.yml' is empty or not found (see: $0 --help)"
 202     echo Checking dependencies:
 203     echo "locale: ${LANG}"
 204     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 205         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 206     echo -n 'virtualenv: '
 207     virtualenv --version \
 208         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install virtualenv (on ubuntu: python-virtualenv)"
 209     echo -n 'ruby: '
 210     ruby -v \
 211         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 212     echo -n 'go: '
 213     go version \
 214         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 215     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 12 ]] \
 216         || fatal "Go >= 1.12 required. See http://golang.org/doc/install"
 217     echo -n 'gcc: '
 218     gcc --version | egrep ^gcc \
 219         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 220     echo -n 'fuse.h: '
 221     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 222         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 223     echo -n 'gnutls.h: '
 224     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 225         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 226     echo -n 'Python2 pyconfig.h: '
 227     find /usr/include -path '*/python2*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 228         || fatal "No Python2 pyconfig.h. Try: apt-get install python2.7-dev"
 229     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 230     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 231         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 232     which netstat \
 233         || fatal "No netstat. Try: apt-get install net-tools"
 234     echo -n 'nginx: '
 235     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 236         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 237     echo -n 'perl: '
 238     perl -v | grep version \
 239         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 240     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 241         echo -n "perl $mod: "
 242         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 243             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 244     done
 245     echo -n 'gitolite: '
 246     which gitolite \
 247         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 248     echo -n 'npm: '
 249     npm --version \
 250         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v6.11.2/node-v6.11.2-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v6.11.2-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 251     echo -n 'cadaver: '
 252     cadaver --version | grep -w cadaver \
 253           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 254     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 255     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 256         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 257     echo -n 'libcurl curl.h: '
 258     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 259         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 260     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 261     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 262         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 263     echo -n 'libpam pam_appl.h: '
 264     find /usr/include -path '*/security/pam_appl.h' | egrep --max-count=1 . \
 265         || fatal "No libpam pam_appl.h. Try: apt-get install libpam-dev"
 266     echo -n 'postgresql: '
 267     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 268     echo -n 'phantomjs: '
 269     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 270     echo -n 'xvfb: '
 271     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 272     echo -n 'graphviz: '
 273     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 274     echo -n 'geckodriver: '
 275     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: wget -O- https://github.com/mozilla/geckodriver/releases/download/v0.23.0/geckodriver-v0.23.0-linux64.tar.gz | sudo tar -C /usr/local/bin -xzf - geckodriver"
 276
 277     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 278       # R SDK stuff
 279       echo -n 'R: '
 280       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 281       echo -n 'testthat: '
 282       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 283       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 284       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 285       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 286       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 287     fi
 288     echo 'procs with /dev/fuse open:'
 289     find /proc/*/fd -lname /dev/fuse 2>/dev/null | cut -d/ -f3 | xargs --no-run-if-empty ps -lywww
 290     echo 'grep fuse /proc/self/mountinfo:'
 291     grep fuse /proc/self/mountinfo
 292 }
 293
 294 rotate_logfile() {
 295   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 296   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 297   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 298     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 299     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 300     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 301   fi
 302 }
 303
 304 declare -a failures
 305 declare -A skip
 306 declare -A only
 307 declare -A testargs
 308 skip[apps/workbench_profile]=1
 309 # nodemanager_integration tests are not reliable, see #12061.
 310 skip[services/nodemanager_integration]=1
 311
 312 while [[ -n "$1" ]]
 313 do
 314     arg="$1"; shift
 315     case "$arg" in
 316         --help)
 317             echo >&2 "$helpmessage"
 318             echo >&2
 319             exit 1
 320             ;;
 321         --skip)
 322             skip[$1]=1; shift
 323             ;;
 324         --only)
 325             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 326             ;;
 327         --short)
 328             short=1
 329             ;;
 330         --interactive)
 331             interactive=1
 332             ;;
 333         --skip-install)
 334             skip[install]=1
 335             ;;
 336         --only-install)
 337             only_install="$1"; shift
 338             ;;
 339         --temp)
 340             temp="$1"; shift
 341             temp_preserve=1
 342             ;;
 343         --leave-temp)
 344             temp_preserve=1
 345             ;;
 346         --repeat)
 347             repeat=$((${1}+0)); shift
 348             ;;
 349         --retry)
 350             retry=1
 351             ;;
 352         *_test=*)
 353             suite="${arg%%_test=*}"
 354             args="${arg#*=}"
 355             testargs["$suite"]="$args"
 356             ;;
 357         *=*)
 358             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 359             ;;
 360         *)
 361             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 362             exit 1
 363             ;;
 364     esac
 365 done
 366
 367 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 368 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 369 NEED_SDK_R=true
 370
 371 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 372    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 373   NEED_SDK_R=false
 374 fi
 375
 376 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 377   NEED_SDK_R=false
 378 fi
 379
 380 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 381         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 382 fi
 383
 384 checkpidfile() {
 385     svc="$1"
 386     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 387     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 388         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 389         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 390         return 1
 391     fi
 392     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 393 }
 394
 395 checkhealth() {
 396     svc="$1"
 397     base=$("${VENVDIR}/bin/python" -c "import yaml; print list(yaml.safe_load(file('$ARVADOS_CONFIG'))['Clusters']['zzzzz']['Services']['$1']['InternalURLs'].keys())[0]")
 398     url="$base/_health/ping"
 399     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 400         echo "${url} failed"
 401         return 1
 402     fi
 403 }
 404
 405 checkdiscoverydoc() {
 406     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 407     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 408         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 409         tail -v $WORKSPACE/tmp/railsapi.log
 410         return 1
 411     fi
 412     echo "${dd} ok"
 413 }
 414
 415 start_services() {
 416     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 417         return 0
 418     fi
 419     . "$VENVDIR/bin/activate"
 420     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, arv-git-httpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 421     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 422         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 423     fi
 424     # Remove empty api.pid file if it exists
 425     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 426         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 427     fi
 428     all_services_stopped=
 429     fail=1
 430
 431     cd "$WORKSPACE" \
 432         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 433         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 434         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 435         && checkpidfile api \
 436         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 437         && eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 438         && checkpidfile nginx \
 439         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 440         && checkpidfile controller \
 441         && checkhealth Controller \
 442         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 443         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 444         && checkpidfile keepproxy \
 445         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 446         && checkpidfile keep-web \
 447         && checkhealth WebDAV \
 448         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_arv-git-httpd \
 449         && checkpidfile arv-git-httpd \
 450         && checkhealth GitHTTP \
 451         && python sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 452         && checkpidfile ws \
 453         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 454         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 455         && fail=0
 456     deactivate
 457     if [[ $fail != 0 ]]; then
 458         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 459     fi
 460     return $fail
 461 }
 462
 463 stop_services() {
 464     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 465         return
 466     fi
 467     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 468     . "$VENVDIR/bin/activate" || return
 469     cd "$WORKSPACE" \
 470         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 471         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_arv-git-httpd \
 472         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 473         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 474         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 475         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 476         && python sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 477         && all_services_stopped=1
 478     deactivate
 479     unset ARVADOS_CONFIG
 480 }
 481
 482 interrupt() {
 483     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 484     exit_cleanly
 485 }
 486 trap interrupt INT
 487
 488 setup_ruby_environment() {
 489     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 490         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 491         using_rvm=true
 492     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 493         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 494         using_rvm=true
 495     else
 496         using_rvm=false
 497     fi
 498
 499     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 500         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 501         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 502         # the environment to the "current gemset", which would lose
 503         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 504         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 505         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 506         # rvm gemset and use it for everything.
 507
 508         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 509             || fatal 'rvm check'
 510
 511         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 512         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 513         # complaint about not being in first place already.
 514         rvm use @default 2>/dev/null
 515
 516         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 517         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 518         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 519         # ruby to the caller.
 520         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 521         rvm use "@${gemset}" --create \
 522             || fatal 'rvm gemset setup'
 523
 524         rvm env
 525         (bundle version | grep -q 2.0.2) || gem install bundler -v 2.0.2
 526         bundle="$(which bundle)"
 527         echo "$bundle"
 528         "$bundle" version | grep 2.0.2 || fatal 'install bundler'
 529     else
 530         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 531         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 532         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 533         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 534         # should be installed, and we should leave it alone.)
 535
 536         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 537             user_gempath="$(gem env gempath)"
 538             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 539         fi
 540         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 541
 542         # When we build and install our own gems, we install them in our
 543         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 544         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 545         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 546
 547         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 548         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 549         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home"
 550
 551         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 552         echo "Will install arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 553         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 554         bundle="$(gem env gempath | cut -f1 -d:)/bin/bundle"
 555         (
 556             export HOME=$GEMHOME
 557             bundlers="$(gem list --details bundler)"
 558             versions=(1.11.0 1.17.3 2.0.2)
 559             for v in ${versions[@]}; do
 560                 if ! echo "$bundlers" | fgrep -q "($v)"; then
 561                     gem install --user $(for v in ${versions[@]}; do echo bundler:${v}; done)
 562                     break
 563                 fi
 564             done
 565             "$bundle" version | tee /dev/stderr | grep -q 'version 2'
 566         ) || fatal 'install bundler'
 567     fi
 568 }
 569
 570 with_test_gemset() {
 571     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 572         "$@"
 573     else
 574         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 575     fi
 576 }
 577
 578 gem_uninstall_if_exists() {
 579     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 580         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 581     fi
 582 }
 583
 584 setup_virtualenv() {
 585     local venvdest="$1"; shift
 586     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip" ]]; then
 587         virtualenv --setuptools "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 588     elif [[ -n "$short" ]]; then
 589         return
 590     fi
 591     if [[ $("$venvdest/bin/python" --version 2>&1) =~ \ 3\.[012]\. ]]; then
 592         # pip 8.0.0 dropped support for python 3.2, e.g., debian wheezy
 593         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7,<8'
 594     else
 595         "$venvdest/bin/pip" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 596     fi
 597 }
 598
 599 initialize() {
 600     # If dependencies like ruby, go, etc. are installed in
 601     # /var/lib/arvados -- presumably by "arvados-server install" --
 602     # then we want to use those versions, instead of whatever happens
 603     # to be installed in /usr.
 604     PATH="/var/lib/arvados/bin:${PATH}"
 605     sanity_checks
 606
 607     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 608
 609     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 610     cd "$WORKSPACE"
 611     find -name '*.pyc' -delete
 612
 613     if [[ -z "$temp" ]]; then
 614         temp="$(mktemp -d)"
 615     fi
 616
 617     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 618     for tmpdir in VENVDIR VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 619     do
 620         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 621             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 622         fi
 623         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 624             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 625         fi
 626     done
 627
 628     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 629
 630     export PERLINSTALLBASE
 631     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 632
 633     export R_LIBS
 634
 635     export GOPATH
 636     # Make sure our compiled binaries under test override anything
 637     # else that might be in the environment.
 638     export PATH=$GOPATH/bin:$PATH
 639
 640     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 641     # that happens even if we don't end up running services that set up
 642     # logging.
 643     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 644     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 645
 646     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 647
 648     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 649     # whine a lot.
 650     setup_ruby_environment
 651
 652     echo "PATH is $PATH"
 653 }
 654
 655 install_env() {
 656     go mod download || fatal "Go deps failed"
 657     which goimports >/dev/null || go get golang.org/x/tools/cmd/goimports || fatal "Go setup failed"
 658
 659     setup_virtualenv "$VENVDIR" --python python2.7
 660     . "$VENVDIR/bin/activate"
 661
 662     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 663     (
 664         set -e
 665         "${VENVDIR}/bin/pip" install PyYAML
 666         "${VENV3DIR}/bin/pip" install PyYAML
 667         cd "$WORKSPACE/sdk/python"
 668         python setup.py install
 669     ) || fatal "installing PyYAML and sdk/python failed"
 670
 671     # Preinstall libcloud if using a fork; otherwise nodemanager "pip
 672     # install" won't pick it up by default.
 673     if [[ -n "$LIBCLOUD_PIN_SRC" ]]; then
 674         pip freeze 2>/dev/null | egrep ^apache-libcloud==$LIBCLOUD_PIN \
 675             || pip install --pre --ignore-installed --no-cache-dir "$LIBCLOUD_PIN_SRC" >/dev/null \
 676             || fatal "pip install apache-libcloud failed"
 677     fi
 678
 679     # Deactivate Python 2 virtualenv
 680     deactivate
 681
 682     # If Python 3 is available, set up its virtualenv in $VENV3DIR.
 683     # Otherwise, skip dependent tests.
 684     PYTHON3=$(which python3)
 685     if [[ ${?} = 0 ]]; then
 686         setup_virtualenv "$VENV3DIR" --python python3
 687     else
 688         PYTHON3=
 689         cat >&2 <<EOF
 690
 691 Warning: python3 could not be found. Python 3 tests will be skipped.
 692
 693 EOF
 694     fi
 695 }
 696
 697 retry() {
 698     remain="${repeat}"
 699     while :
 700     do
 701         if ${@}; then
 702             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 703                 remain=$((${remain}-1))
 704                 title "(repeating ${remain} more times)"
 705             else
 706                 break
 707             fi
 708         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 709             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 710             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 711             then
 712                 break
 713             fi
 714         else
 715             break
 716         fi
 717     done
 718 }
 719
 720 do_test() {
 721     case "${1}" in
 722         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 723             suite=apps/workbench
 724             ;;
 725         services/nodemanager | services/nodemanager_integration)
 726             suite=services/nodemanager_suite
 727             ;;
 728         *)
 729             suite="${1}"
 730             ;;
 731     esac
 732     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 733               -n "${skip[$1]}" || \
 734               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 735         return 0
 736     fi
 737     case "${1}" in
 738         services/api)
 739             stop_services
 740             check_arvados_config "$1"
 741             ;;
 742         gofmt | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cloud/cloudtest | lib/cmd | lib/dispatchcloud/ssh_executor | lib/dispatchcloud/worker)
 743             check_arvados_config "$1"
 744             # don't care whether services are running
 745             ;;
 746         *)
 747             check_arvados_config "$1"
 748             if ! start_services; then
 749                 checkexit 1 "$1 tests"
 750                 title "test $1 -- failed to start services"
 751                 return 1
 752             fi
 753             ;;
 754     esac
 755     retry do_test_once ${@}
 756 }
 757
 758 go_ldflags() {
 759     version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}
 760     echo "-X git.arvados.org/arvados.git/lib/cmd.version=${version} -X main.version=${version}"
 761 }
 762
 763 do_test_once() {
 764     unset result
 765
 766     title "test $1"
 767     timer_reset
 768
 769     result=
 770     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 771     if ! . "$VENVDIR/bin/activate"
 772     then
 773         result=1
 774     elif [[ "$2" == "go" ]]
 775     then
 776         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 777         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 778         # We do "go install" here to catch compilation errors
 779         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 780         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 781         # compilation errors.
 782         go install -ldflags "$(go_ldflags)" "$WORKSPACE/$1" && \
 783             cd "$WORKSPACE/$1" && \
 784             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 785         then
 786             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 787             # does:
 788             go test ${short:+-short} ${testargs[$1]}
 789         else
 790             # The above form gets verbose even when testargs is
 791             # empty, so use this form in such cases:
 792             go test ${short:+-short} ${coverflags[@]} "git.arvados.org/arvados.git/$1"
 793         fi
 794         result=${result:-$?}
 795         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 796         then
 797             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 798             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 799         fi
 800         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 801     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 802     then
 803         tries=0
 804         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 805         do
 806             tries=$((${tries}+1))
 807             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 808             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 809             if [[ -e "${3}activate" ]]; then
 810                 . "${3}activate"
 811             fi
 812             python setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 813             result=$?
 814             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 815             then
 816                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 817                 continue
 818             else
 819                 break
 820             fi
 821         done
 822     elif [[ "$2" != "" ]]
 823     then
 824         "test_$2"
 825     else
 826         "test_$1"
 827     fi
 828     result=${result:-$?}
 829     checkexit $result "$1 tests"
 830     title "test $1 -- `timer`"
 831     return $result
 832 }
 833
 834 check_arvados_config() {
 835     if [[ "$1" = "env" ]] ; then
 836         return
 837     fi
 838     if [[ -z "$ARVADOS_CONFIG" ]] ; then
 839         # Create config file.  The run_test_server script requires PyYAML,
 840         # so virtualenv needs to be active.  Downstream steps like
 841         # workbench install which require a valid config.yml.
 842         if [[ ! -s "$VENVDIR/bin/activate" ]] ; then
 843             install_env
 844         fi
 845         . "$VENVDIR/bin/activate"
 846         cd "$WORKSPACE"
 847         eval $(python sdk/python/tests/run_test_server.py setup_config)
 848         deactivate
 849     fi
 850 }
 851
 852 do_install() {
 853     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 854         return 0
 855     fi
 856     check_arvados_config "$1"
 857     retry do_install_once ${@}
 858 }
 859
 860 do_install_once() {
 861     title "install $1"
 862     timer_reset
 863
 864     result=
 865     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 866     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENVDIR/bin/activate"; then
 867         result=1
 868     elif [[ "$2" == "go" ]]
 869     then
 870         go install -ldflags "$(go_ldflags)" "$WORKSPACE/$1"
 871     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 872     then
 873         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 874         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 875
 876         # Need to change to a different directory after creating
 877         # the source dist package to avoid a pip bug.
 878         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 879
 880         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 881         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 882         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 883         # install" ensures that we've actually installed the local package
 884         # we just built.
 885         cd "$WORKSPACE/$1" \
 886             && "${3}python" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 887             && cd "$WORKSPACE" \
 888             && "${3}pip" install --no-cache-dir "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 889             && "${3}pip" install --no-cache-dir --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 890     elif [[ "$2" != "" ]]
 891     then
 892         "install_$2"
 893     else
 894         "install_$1"
 895     fi
 896     result=${result:-$?}
 897     checkexit $result "$1 install"
 898     title "install $1 -- `timer`"
 899     return $result
 900 }
 901
 902 bundle_install_trylocal() {
 903     (
 904         set -e
 905         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 906         if ! "$bundle" install --local --no-deployment; then
 907             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 908             "$bundle" install --no-deployment
 909         fi
 910         "$bundle" package
 911     )
 912 }
 913
 914 install_doc() {
 915     cd "$WORKSPACE/doc" \
 916         && bundle_install_trylocal \
 917         && rm -rf .site
 918 }
 919
 920 install_gem() {
 921     gemname=$1
 922     srcpath=$2
 923     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 924         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 925         && bundle_install_trylocal \
 926         && gem build "$gemname.gemspec" \
 927         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 928 }
 929
 930 install_sdk/ruby() {
 931     install_gem arvados sdk/ruby
 932 }
 933
 934 install_sdk/R() {
 935   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 936     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 937        && Rscript --vanilla install_deps.R
 938   fi
 939 }
 940
 941 install_sdk/perl() {
 942     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 943         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 944         && make install INSTALLDIRS=perl
 945 }
 946
 947 install_sdk/cli() {
 948     install_gem arvados-cli sdk/cli
 949 }
 950
 951 install_services/login-sync() {
 952     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 953 }
 954
 955 install_services/api() {
 956     stop_services
 957     check_arvados_config "services/api"
 958     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 959         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 960             || return 1
 961
 962     rm -f config/environments/test.rb
 963     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 964
 965     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 966     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 967     # is a postgresql superuser.
 968     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 969         && test_database=$("${VENVDIR}/bin/python" -c "import yaml; print yaml.safe_load(file('$ARVADOS_CONFIG'))['Clusters']['zzzzz']['PostgreSQL']['Connection']['dbname']") \
 970         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 971
 972     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 973
 974     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 975     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 976         (
 977             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 978             set -ex
 979             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 980             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 981         ) || return 1
 982     fi
 983
 984     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 985         && rm -rf tmp/git \
 986         && mkdir -p tmp/git \
 987         && cd tmp/git \
 988         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 989         && mkdir -p internal.git \
 990         && git --git-dir internal.git init \
 991             || return 1
 992
 993     (
 994         set -e
 995         cd "$WORKSPACE/services/api"
 996         export RAILS_ENV=test
 997         if "$bundle" exec rails db:environment:set ; then
 998             "$bundle" exec rake db:drop
 999         fi
1000         "$bundle" exec rake db:setup
1001         "$bundle" exec rake db:fixtures:load
1002     ) || return 1
1003 }
1004
1005 declare -a pythonstuff
1006 pythonstuff=(
1007     sdk/pam
1008     sdk/python
1009     sdk/python:py3
1010     sdk/cwl:py3
1011     services/dockercleaner:py3
1012     services/fuse
1013     services/fuse:py3
1014     services/nodemanager
1015     tools/crunchstat-summary
1016     tools/crunchstat-summary:py3
1017 )
1018
1019 declare -a gostuff
1020 gostuff=($(cd "$WORKSPACE" && git grep -lw func | grep \\.go | sed -e 's/\/[^\/]*$//' | sort -u))
1021
1022 install_apps/workbench() {
1023     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1024         && mkdir -p tmp/cache \
1025         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1026         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets "$bundle" exec rake npm:install
1027 }
1028
1029 test_doc() {
1030     (
1031         set -e
1032         cd "$WORKSPACE/doc"
1033         ARVADOS_API_HOST=qr1hi.arvadosapi.com
1034         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1035         # do much good!
1036         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ "$bundle" exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1037     )
1038 }
1039
1040 test_gofmt() {
1041     cd "$WORKSPACE" || return 1
1042     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1043     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1044 }
1045
1046 test_services/api() {
1047     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1048     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1049         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake test TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[services/api]}
1050 }
1051
1052 test_sdk/ruby() {
1053     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1054         && "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1055 }
1056
1057 test_sdk/R() {
1058   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1059     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1060         && Rscript --vanilla run_test.R
1061   fi
1062 }
1063
1064 test_sdk/cli() {
1065     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1066         && mkdir -p /tmp/keep \
1067         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1068 }
1069
1070 test_sdk/java-v2() {
1071     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test ${testargs[sdk/java-v2]}
1072 }
1073
1074 test_services/login-sync() {
1075     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1076         && "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1077 }
1078
1079 test_services/nodemanager_integration() {
1080     cd "$WORKSPACE/services/nodemanager" \
1081         && tests/integration_test.py ${testargs[services/nodemanager_integration]}
1082 }
1083
1084 test_apps/workbench_units() {
1085     local TASK="test:units"
1086     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1087         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1088 }
1089
1090 test_apps/workbench_functionals() {
1091     local TASK="test:functionals"
1092     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1093         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1094 }
1095
1096 test_apps/workbench_integration() {
1097     local TASK="test:integration"
1098     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1099         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1100 }
1101
1102 test_apps/workbench_benchmark() {
1103     local TASK="test:benchmark"
1104     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1105         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1106 }
1107
1108 test_apps/workbench_profile() {
1109     local TASK="test:profile"
1110     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1111         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_profile]}
1112 }
1113
1114 install_deps() {
1115     # Install parts needed by test suites
1116     do_install env
1117     do_install cmd/arvados-server go
1118     do_install sdk/cli
1119     do_install sdk/perl
1120     do_install sdk/python pip
1121     do_install sdk/python pip "${VENV3DIR}/bin/"
1122     do_install sdk/ruby
1123     do_install services/api
1124     do_install services/arv-git-httpd go
1125     do_install services/keepproxy go
1126     do_install services/keepstore go
1127     do_install services/keep-web go
1128     do_install services/ws go
1129 }
1130
1131 install_all() {
1132     do_install env
1133     do_install doc
1134     do_install sdk/ruby
1135     do_install sdk/R
1136     do_install sdk/perl
1137     do_install sdk/cli
1138     do_install services/login-sync
1139     for p in "${pythonstuff[@]}"
1140     do
1141         dir=${p%:py3}
1142         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1143             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1144                 do_install ${dir} pip
1145             fi
1146         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1147             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1148                 do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1149             fi
1150         fi
1151     done
1152     for g in "${gostuff[@]}"
1153     do
1154         do_install "$g" go
1155     done
1156     do_install services/api
1157     do_install apps/workbench
1158 }
1159
1160 test_all() {
1161     stop_services
1162     do_test services/api
1163
1164     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1165     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1166     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1167         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1168         exit_cleanly
1169     fi
1170
1171     do_test gofmt
1172     do_test doc
1173     do_test sdk/ruby
1174     do_test sdk/R
1175     do_test sdk/cli
1176     do_test services/login-sync
1177     do_test sdk/java-v2
1178     do_test services/nodemanager_integration
1179     for p in "${pythonstuff[@]}"
1180     do
1181         dir=${p%:py3}
1182         if [[ ${dir} = ${p} ]]; then
1183             if [[ -z ${skip[python2]} ]]; then
1184                 do_test ${dir} pip
1185             fi
1186         elif [[ -n ${PYTHON3} ]]; then
1187             if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1188                 do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1189             fi
1190         fi
1191     done
1192
1193     for g in "${gostuff[@]}"
1194     do
1195         do_test "$g" go
1196     done
1197     do_test apps/workbench_units
1198     do_test apps/workbench_functionals
1199     do_test apps/workbench_integration
1200     do_test apps/workbench_benchmark
1201     do_test apps/workbench_profile
1202 }
1203
1204 help_interactive() {
1205     echo "== Interactive commands:"
1206     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1207     echo "test TARGET"
1208     echo "10 test TARGET         (run test 10 times)"
1209     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1210     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1211     echo "install TARGET"
1212     echo "install env            (go/python libs)"
1213     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1214     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1215     echo "exit"
1216     echo "== Test targets:"
1217     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1218 }
1219
1220 initialize
1221
1222 declare -A testfuncargs=()
1223 for g in "${gostuff[@]}"; do
1224     testfuncargs[$g]="$g go"
1225 done
1226 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1227     dir=${p%:py3}
1228     testfuncargs[$dir]="$dir pip $VENVDIR/bin/"
1229     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1230 done
1231
1232 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1233 testfuncargs["sdk/R"]="sdk/R"
1234 testfuncargs["sdk/java-v2"]="sdk/java-v2"
1235 testfuncargs["apps/workbench_units"]="apps/workbench_units"
1236 testfuncargs["apps/workbench_functionals"]="apps/workbench_functionals"
1237 testfuncargs["apps/workbench_integration"]="apps/workbench_integration"
1238 testfuncargs["apps/workbench_benchmark"]="apps/workbench_benchmark"
1239 testfuncargs["apps/workbench_profile"]="apps/workbench_profile"
1240
1241 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1242     install_all
1243     test_all
1244 else
1245     skip=()
1246     only=()
1247     only_install=()
1248     if [[ -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1249     setnextcmd() {
1250         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1251             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1252             # and pre-populating the command will only cause trouble
1253             nextcmd=
1254         elif [[ ! -e "$VENVDIR/bin/activate" ]]; then
1255             nextcmd="install deps"
1256         else
1257             nextcmd=""
1258         fi
1259     }
1260     echo
1261     help_interactive
1262     nextcmd="install deps"
1263     setnextcmd
1264     HISTFILE="$WORKSPACE/tmp/.history"
1265     history -r
1266     while read -p 'What next? ' -e -i "$nextcmd" nextcmd; do
1267         history -s "$nextcmd"
1268         history -w
1269         count=1
1270         if [[ "${nextcmd}" =~ ^[0-9] ]]; then
1271           read count nextcmd <<<"${nextcmd}"
1272         fi
1273         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1274         target="${target%/}"
1275         target="${target/\/:/:}"
1276         case "${verb}" in
1277             "exit" | "quit")
1278                 exit_cleanly
1279                 ;;
1280             "reset")
1281                 stop_services
1282                 ;;
1283             "test" | "install")
1284                 case "$target" in
1285                     "")
1286                         help_interactive
1287                         ;;
1288                     all | deps)
1289                         ${verb}_${target}
1290                         ;;
1291                     *)
1292                         argstarget=${target%:py3}
1293                         testargs["$argstarget"]="${opts}"
1294                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1295                         tt="${tt:-$target}"
1296                         while [ $count -gt 0 ]; do
1297                           do_$verb $tt
1298                           let "count=count-1"
1299                         done
1300                         ;;
1301                 esac
1302                 ;;
1303             "" | "help" | *)
1304                 help_interactive
1305                 ;;
1306         esac
1307         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1308             report_outcomes
1309             successes=()
1310             failures=()
1311         fi
1312         cd "$WORKSPACE"
1313         setnextcmd
1314     done
1315     echo
1316 fi
1317 exit_cleanly