build/run-tests.sh

   1 #!/bin/bash
   2 # Copyright (C) The Arvados Authors. All rights reserved.
   3 #
   4 # SPDX-License-Identifier: AGPL-3.0
   5
   6 COLUMNS=80
   7 . `dirname "$(readlink -f "$0")"`/run-library.sh
   8
   9 read -rd "\000" helpmessage <<EOF
  10 $(basename $0): Install and test Arvados components.
  11
  12 Exit non-zero if any tests fail.
  13
  14 Syntax:
  15         $(basename $0) WORKSPACE=/path/to/arvados [options]
  16
  17 Options:
  18
  19 --skip FOO     Do not test the FOO component.
  20 --skip sanity  Skip initial dev environment sanity checks.
  21 --skip install Do not run any install steps. Just run tests.
  22                You should provide GOPATH, GEMHOME, and VENVDIR options
  23                from a previous invocation if you use this option.
  24 --only FOO     Do not test anything except the FOO component.
  25 --temp DIR     Install components and dependencies under DIR instead of
  26                making a new temporary directory. Implies --leave-temp.
  27 --leave-temp   Do not remove GOPATH, virtualenv, and other temp dirs at exit.
  28                Instead, show the path to give as --temp to reuse them in
  29                subsequent invocations.
  30 --repeat N     Repeat each install/test step until it succeeds N times.
  31 --retry        Prompt to retry if an install or test suite fails.
  32 --only-install Run specific install step
  33 --short        Skip (or scale down) some slow tests.
  34 --interactive  Set up, then prompt for test/install steps to perform.
  35 WORKSPACE=path Arvados source tree to test.
  36 CONFIGSRC=path Dir with config.yml file containing PostgreSQL section for use by tests.
  37 services/api_test="TEST=test/functional/arvados/v1/collections_controller_test.rb"
  38                Restrict apiserver tests to the given file
  39 sdk/python_test="--test-suite tests.test_keep_locator"
  40                Restrict Python SDK tests to the given class
  41 apps/workbench_test="TEST=test/integration/pipeline_instances_test.rb"
  42                Restrict Workbench tests to the given file
  43 services/githttpd_test="-check.vv"
  44                Show all log messages, even when tests pass (also works
  45                with services/keepstore_test etc.)
  46 ARVADOS_DEBUG=1
  47                Print more debug messages
  48 envvar=value   Set \$envvar to value. Primarily useful for WORKSPACE,
  49                *_test, and other examples shown above.
  50
  51 Assuming "--skip install" is not given, all components are installed
  52 into \$GOPATH, \$VENDIR, and \$GEMHOME before running any tests. Many
  53 test suites depend on other components being installed, and installing
  54 everything tends to be quicker than debugging dependencies.
  55
  56 As a special concession to the current CI server config, CONFIGSRC
  57 defaults to $HOME/arvados-api-server if that directory exists.
  58
  59 More information and background:
  60
  61 https://arvados.org/projects/arvados/wiki/Running_tests
  62
  63 Available tests:
  64
  65 apps/workbench (*)
  66 apps/workbench_units (*)
  67 apps/workbench_functionals (*)
  68 apps/workbench_integration (*)
  69 apps/workbench_benchmark
  70 apps/workbench_profile
  71 cmd/arvados-client
  72 cmd/arvados-package
  73 cmd/arvados-server
  74 doc
  75 lib/cli
  76 lib/cmd
  77 lib/controller
  78 lib/controller/federation
  79 lib/controller/railsproxy
  80 lib/controller/router
  81 lib/controller/rpc
  82 lib/crunchstat
  83 lib/crunch-run
  84 lib/cloud
  85 lib/cloud/azure
  86 lib/cloud/cloudtest
  87 lib/dispatchcloud
  88 lib/dispatchcloud/container
  89 lib/dispatchcloud/scheduler
  90 lib/dispatchcloud/sshexecutor
  91 lib/dispatchcloud/worker
  92 lib/mount
  93 lib/pam
  94 lib/service
  95 services/api
  96 services/githttpd
  97 services/crunchstat
  98 services/dockercleaner
  99 services/fuse
 100 services/fuse:py3
 101 services/health
 102 services/keep-web
 103 services/keepproxy
 104 services/keepstore
 105 services/keep-balance
 106 services/login-sync
 107 services/crunch-dispatch-local
 108 services/crunch-dispatch-slurm
 109 services/ws
 110 sdk/cli
 111 sdk/python
 112 sdk/python:py3
 113 sdk/ruby
 114 sdk/go/arvados
 115 sdk/go/arvadosclient
 116 sdk/go/auth
 117 sdk/go/dispatch
 118 sdk/go/keepclient
 119 sdk/go/health
 120 sdk/go/httpserver
 121 sdk/go/manifest
 122 sdk/go/blockdigest
 123 sdk/go/asyncbuf
 124 sdk/go/stats
 125 sdk/go/crunchrunner
 126 sdk/cwl:py3
 127 sdk/R
 128 sdk/java-v2
 129 tools/sync-groups
 130 tools/crunchstat-summary
 131 tools/crunchstat-summary:py3
 132 tools/keep-exercise
 133 tools/keep-rsync
 134 tools/keep-block-check
 135
 136 (*) apps/workbench is shorthand for apps/workbench_units +
 137     apps/workbench_functionals + apps/workbench_integration
 138
 139 EOF
 140
 141 # First make sure to remove any ARVADOS_ variables from the calling
 142 # environment that could interfere with the tests.
 143 unset $(env | cut -d= -f1 | grep \^ARVADOS_)
 144
 145 # Reset other variables that could affect our [tests'] behavior by
 146 # accident.
 147 GITDIR=
 148 GOPATH=
 149 VENVDIR=
 150 VENV3DIR=
 151 PYTHONPATH=
 152 GEMHOME=
 153 PERLINSTALLBASE=
 154 R_LIBS=
 155 export LANG=en_US.UTF-8
 156
 157 short=
 158 only_install=
 159 temp=
 160 temp_preserve=
 161
 162 ignore_sigint=
 163
 164 clear_temp() {
 165     if [[ -z "$temp" ]]; then
 166         # we did not even get as far as making a temp dir
 167         :
 168     elif [[ -z "$temp_preserve" ]]; then
 169         # Go creates readonly dirs in the module cache, which cause
 170         # "rm -rf" to fail unless we chmod first.
 171         chmod -R u+w "$temp"
 172         rm -rf "$temp"
 173     else
 174         echo "Leaving behind temp dirs in $temp"
 175     fi
 176 }
 177
 178 fatal() {
 179     clear_temp
 180     echo >&2 "Fatal: $* (encountered in ${FUNCNAME[1]} at ${BASH_SOURCE[1]} line ${BASH_LINENO[0]})"
 181     exit 1
 182 }
 183
 184 exit_cleanly() {
 185     trap - INT
 186     if which create-plot-data-from-log.sh >/dev/null; then
 187         create-plot-data-from-log.sh $BUILD_NUMBER "$WORKSPACE/apps/workbench/log/test.log" "$WORKSPACE/apps/workbench/log/"
 188     fi
 189     rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 190     stop_services
 191     rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
 192     report_outcomes
 193     clear_temp
 194     exit ${#failures}
 195 }
 196
 197 sanity_checks() {
 198     [[ -n "${skip[sanity]}" ]] && return 0
 199     ( [[ -n "$WORKSPACE" ]] && [[ -d "$WORKSPACE/services" ]] ) \
 200         || fatal "WORKSPACE environment variable not set to a source directory (see: $0 --help)"
 201     [[ -z "$CONFIGSRC" ]] || [[ -s "$CONFIGSRC/config.yml" ]] \
 202         || fatal "CONFIGSRC is $CONFIGSRC but '$CONFIGSRC/config.yml' is empty or not found (see: $0 --help)"
 203     echo Checking dependencies:
 204     echo "locale: ${LANG}"
 205     [[ "$(locale charmap)" = "UTF-8" ]] \
 206         || fatal "Locale '${LANG}' is broken/missing. Try: echo ${LANG} | sudo tee -a /etc/locale.gen && sudo locale-gen"
 207     echo -n 'ruby: '
 208     ruby -v \
 209         || fatal "No ruby. Install >=2.1.9 (using rbenv, rvm, or source)"
 210     echo -n 'go: '
 211     go version \
 212         || fatal "No go binary. See http://golang.org/doc/install"
 213     [[ $(go version) =~ go1.([0-9]+) ]] && [[ ${BASH_REMATCH[1]} -ge 12 ]] \
 214         || fatal "Go >= 1.12 required. See http://golang.org/doc/install"
 215     echo -n 'gcc: '
 216     gcc --version | egrep ^gcc \
 217         || fatal "No gcc. Try: apt-get install build-essential"
 218     echo -n 'fuse.h: '
 219     find /usr/include -path '*fuse/fuse.h' | egrep --max-count=1 . \
 220         || fatal "No fuse/fuse.h. Try: apt-get install libfuse-dev"
 221     echo -n 'gnutls.h: '
 222     find /usr/include -path '*gnutls/gnutls.h' | egrep --max-count=1 . \
 223         || fatal "No gnutls/gnutls.h. Try: apt-get install libgnutls28-dev"
 224     echo -n 'virtualenv: '
 225     python3 -m venv -h | egrep --max-count=1 . \
 226         || fatal "No virtualenv. Try: apt-get install python3-venv"
 227     echo -n 'Python3 pyconfig.h: '
 228     find /usr/include -path '*/python3*/pyconfig.h' | egrep --max-count=1 . \
 229         || fatal "No Python3 pyconfig.h. Try: apt-get install python3-dev"
 230     which netstat \
 231         || fatal "No netstat. Try: apt-get install net-tools"
 232     echo -n 'nginx: '
 233     PATH="$PATH:/sbin:/usr/sbin:/usr/local/sbin" nginx -v \
 234         || fatal "No nginx. Try: apt-get install nginx"
 235     echo -n 'perl: '
 236     perl -v | grep version \
 237         || fatal "No perl. Try: apt-get install perl"
 238     for mod in ExtUtils::MakeMaker JSON LWP Net::SSL; do
 239         echo -n "perl $mod: "
 240         perl -e "use $mod; print \"\$$mod::VERSION\\n\"" \
 241             || fatal "No $mod. Try: apt-get install perl-modules libcrypt-ssleay-perl libjson-perl libwww-perl"
 242     done
 243     echo -n 'gitolite: '
 244     which gitolite \
 245         || fatal "No gitolite. Try: apt-get install gitolite3"
 246     echo -n 'npm: '
 247     npm --version \
 248         || fatal "No npm. Try: wget -O- https://nodejs.org/dist/v10.23.1/node-v10.23.1-linux-x64.tar.xz | sudo tar -C /usr/local -xJf - && sudo ln -s ../node-v10.23.1-linux-x64/bin/{node,npm} /usr/local/bin/"
 249     echo -n 'cadaver: '
 250     cadaver --version | grep -w cadaver \
 251           || fatal "No cadaver. Try: apt-get install cadaver"
 252     echo -n 'libattr1 xattr.h: '
 253     find /usr/include -path '*/attr/xattr.h' | egrep --max-count=1 . \
 254         || fatal "No libattr1 xattr.h. Try: apt-get install libattr1-dev"
 255     echo -n 'libcurl curl.h: '
 256     find /usr/include -path '*/curl/curl.h' | egrep --max-count=1 . \
 257         || fatal "No libcurl curl.h. Try: apt-get install libcurl4-gnutls-dev"
 258     echo -n 'libpq libpq-fe.h: '
 259     find /usr/include -path '*/postgresql/libpq-fe.h' | egrep --max-count=1 . \
 260         || fatal "No libpq libpq-fe.h. Try: apt-get install libpq-dev"
 261     echo -n 'libpam pam_appl.h: '
 262     find /usr/include -path '*/security/pam_appl.h' | egrep --max-count=1 . \
 263         || fatal "No libpam pam_appl.h. Try: apt-get install libpam0g-dev"
 264     echo -n 'postgresql: '
 265     psql --version || fatal "No postgresql. Try: apt-get install postgresql postgresql-client-common"
 266     echo -n 'phantomjs: '
 267     phantomjs --version || fatal "No phantomjs. Try: apt-get install phantomjs"
 268     echo -n 'xvfb: '
 269     which Xvfb || fatal "No xvfb. Try: apt-get install xvfb"
 270     echo -n 'graphviz: '
 271     dot -V || fatal "No graphviz. Try: apt-get install graphviz"
 272     echo -n 'geckodriver: '
 273     geckodriver --version | grep ^geckodriver || echo "No geckodriver. Try: arvados-server install"
 274     echo -n 'singularity: '
 275     singularity --version || fatal "No singularity. Try: arvados-server install"
 276     echo -n 'docker client: '
 277     docker --version || echo "No docker client. Try: arvados-server install"
 278     echo -n 'docker server: '
 279     docker info --format='{{.ServerVersion}}' || echo "No docker server. Try: arvados-server install"
 280
 281     if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 282       # R SDK stuff
 283       echo -n 'R: '
 284       which Rscript || fatal "No Rscript. Try: apt-get install r-base"
 285       echo -n 'testthat: '
 286       Rscript -e "library('testthat')" || fatal "No testthat. Try: apt-get install r-cran-testthat"
 287       # needed for roxygen2, needed for devtools, needed for R sdk
 288       pkg-config --exists libxml-2.0 || fatal "No libxml2. Try: apt-get install libxml2-dev"
 289       # needed for pkgdown, builds R SDK doc pages
 290       which pandoc || fatal "No pandoc. Try: apt-get install pandoc"
 291     fi
 292     echo 'procs with /dev/fuse open:'
 293     find /proc/*/fd -lname /dev/fuse 2>/dev/null | cut -d/ -f3 | xargs --no-run-if-empty ps -lywww
 294     echo 'grep fuse /proc/self/mountinfo:'
 295     grep fuse /proc/self/mountinfo
 296 }
 297
 298 rotate_logfile() {
 299   # i.e.  rotate_logfile "$WORKSPACE/apps/workbench/log/" "test.log"
 300   # $BUILD_NUMBER is set by Jenkins if this script is being called as part of a Jenkins run
 301   if [[ -f "$1/$2" ]]; then
 302     THEDATE=`date +%Y%m%d%H%M%S`
 303     mv "$1/$2" "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 304     gzip "$1/$THEDATE-$BUILD_NUMBER-$2"
 305   fi
 306 }
 307
 308 declare -a failures
 309 declare -A skip
 310 declare -A only
 311 declare -A testargs
 312 skip[apps/workbench_profile]=1
 313
 314 while [[ -n "$1" ]]
 315 do
 316     arg="$1"; shift
 317     case "$arg" in
 318         --help)
 319             echo >&2 "$helpmessage"
 320             echo >&2
 321             exit 1
 322             ;;
 323         --skip)
 324             skip[$1]=1; shift
 325             ;;
 326         --only)
 327             only[$1]=1; skip[$1]=""; shift
 328             ;;
 329         --short)
 330             short=1
 331             ;;
 332         --interactive)
 333             interactive=1
 334             ;;
 335         --skip-install)
 336             skip[install]=1
 337             ;;
 338         --only-install)
 339             only_install="$1"; shift
 340             ;;
 341         --temp)
 342             temp="$1"; shift
 343             temp_preserve=1
 344             ;;
 345         --leave-temp)
 346             temp_preserve=1
 347             ;;
 348         --repeat)
 349             repeat=$((${1}+0)); shift
 350             ;;
 351         --retry)
 352             retry=1
 353             ;;
 354         *_test=*)
 355             suite="${arg%%_test=*}"
 356             args="${arg#*=}"
 357             testargs["$suite"]="$args"
 358             ;;
 359         *=*)
 360             eval export $(echo $arg | cut -d= -f1)=\"$(echo $arg | cut -d= -f2-)\"
 361             ;;
 362         *)
 363             echo >&2 "$0: Unrecognized option: '$arg'. Try: $0 --help"
 364             exit 1
 365             ;;
 366     esac
 367 done
 368
 369 # R SDK installation is very slow (~360s in a clean environment) and only
 370 # required when testing it. Skip that step if it is not needed.
 371 NEED_SDK_R=true
 372
 373 if [[ ${#only[@]} -ne 0 ]] &&
 374    [[ -z "${only['sdk/R']}" && -z "${only['doc']}" ]]; then
 375   NEED_SDK_R=false
 376 fi
 377
 378 if [[ ${skip["sdk/R"]} == 1 && ${skip["doc"]} == 1 ]]; then
 379   NEED_SDK_R=false
 380 fi
 381
 382 if [[ $NEED_SDK_R == false ]]; then
 383         echo "R SDK not needed, it will not be installed."
 384 fi
 385
 386 checkpidfile() {
 387     svc="$1"
 388     pid="$(cat "$WORKSPACE/tmp/${svc}.pid")"
 389     if [[ -z "$pid" ]] || ! kill -0 "$pid"; then
 390         tail $WORKSPACE/tmp/${1}*.log
 391         echo "${svc} pid ${pid} not running"
 392         return 1
 393     fi
 394     echo "${svc} pid ${pid} ok"
 395 }
 396
 397 checkhealth() {
 398     svc="$1"
 399     base=$("${VENV3DIR}/bin/python3" -c "import yaml; print(list(yaml.safe_load(open('$ARVADOS_CONFIG','r'))['Clusters']['zzzzz']['Services']['$1']['InternalURLs'].keys())[0])")
 400     url="$base/_health/ping"
 401     if ! curl -Ss -H "Authorization: Bearer e687950a23c3a9bceec28c6223a06c79" "${url}" | tee -a /dev/stderr | grep '"OK"'; then
 402         echo "${url} failed"
 403         return 1
 404     fi
 405 }
 406
 407 checkdiscoverydoc() {
 408     dd="https://${1}/discovery/v1/apis/arvados/v1/rest"
 409     if ! (set -o pipefail; curl -fsk "$dd" | grep -q ^{ ); then
 410         echo >&2 "ERROR: could not retrieve discovery doc from RailsAPI at $dd"
 411         tail -v $WORKSPACE/tmp/railsapi.log
 412         return 1
 413     fi
 414     echo "${dd} ok"
 415 }
 416
 417 start_services() {
 418     if [[ -n "$ARVADOS_TEST_API_HOST" ]]; then
 419         return 0
 420     fi
 421     . "$VENV3DIR/bin/activate"
 422     echo 'Starting API, controller, keepproxy, keep-web, githttpd, ws, and nginx ssl proxy...'
 423     if [[ ! -d "$WORKSPACE/services/api/log" ]]; then
 424         mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/log"
 425     fi
 426     # Remove empty api.pid file if it exists
 427     if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid" && ! -s "$WORKSPACE/tmp/api.pid" ]]; then
 428         rm -f "$WORKSPACE/tmp/api.pid"
 429     fi
 430     all_services_stopped=
 431     fail=1
 432
 433     cd "$WORKSPACE" \
 434         && eval $(python3 sdk/python/tests/run_test_server.py start --auth admin) \
 435         && export ARVADOS_TEST_API_HOST="$ARVADOS_API_HOST" \
 436         && export ARVADOS_TEST_API_INSTALLED="$$" \
 437         && checkpidfile api \
 438         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 439         && eval $(python3 sdk/python/tests/run_test_server.py start_nginx) \
 440         && checkpidfile nginx \
 441         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py start_controller \
 442         && checkpidfile controller \
 443         && checkhealth Controller \
 444         && checkdiscoverydoc $ARVADOS_API_HOST \
 445         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep_proxy \
 446         && checkpidfile keepproxy \
 447         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py start_keep-web \
 448         && checkpidfile keep-web \
 449         && checkhealth WebDAV \
 450         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py start_githttpd \
 451         && checkpidfile githttpd \
 452         && checkhealth GitHTTP \
 453         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py start_ws \
 454         && checkpidfile ws \
 455         && export ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES=1 \
 456         && (env | egrep ^ARVADOS) \
 457         && fail=0
 458     deactivate
 459     if [[ $fail != 0 ]]; then
 460         unset ARVADOS_TEST_API_HOST
 461     fi
 462     return $fail
 463 }
 464
 465 stop_services() {
 466     if [[ -n "$all_services_stopped" ]]; then
 467         return
 468     fi
 469     unset ARVADOS_TEST_API_HOST ARVADOS_TEST_PROXY_SERVICES
 470     . "$VENV3DIR/bin/activate" || return
 471     cd "$WORKSPACE" \
 472         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py stop_nginx \
 473         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py stop_githttpd \
 474         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py stop_ws \
 475         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep-web \
 476         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py stop_keep_proxy \
 477         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py stop_controller \
 478         && python3 sdk/python/tests/run_test_server.py stop \
 479         && all_services_stopped=1
 480     deactivate
 481     unset ARVADOS_CONFIG
 482 }
 483
 484 interrupt() {
 485     if [[ -n "$ignore_sigint" ]]; then
 486         echo >&2 "ignored SIGINT"
 487         return
 488     fi
 489     failures+=("($(basename $0) interrupted)")
 490     exit_cleanly
 491 }
 492 trap interrupt INT
 493
 494 setup_ruby_environment() {
 495     if [[ -s "$HOME/.rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 496         source "$HOME/.rvm/scripts/rvm"
 497         using_rvm=true
 498     elif [[ -s "/usr/local/rvm/scripts/rvm" ]] ; then
 499         source "/usr/local/rvm/scripts/rvm"
 500         using_rvm=true
 501     else
 502         using_rvm=false
 503     fi
 504
 505     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 506         # If rvm is in use, we can't just put separate "dependencies"
 507         # and "gems-under-test" paths to GEM_PATH: passenger resets
 508         # the environment to the "current gemset", which would lose
 509         # our GEM_PATH and prevent our test suites from running ruby
 510         # programs (for example, the Workbench test suite could not
 511         # boot an API server or run arv). Instead, we have to make an
 512         # rvm gemset and use it for everything.
 513
 514         [[ `type rvm | head -n1` == "rvm is a function" ]] \
 515             || fatal 'rvm check'
 516
 517         # Put rvm's favorite path back in first place (overriding
 518         # virtualenv, which just put itself there). Ignore rvm's
 519         # complaint about not being in first place already.
 520         rvm use @default 2>/dev/null
 521
 522         # Create (if needed) and switch to an @arvados-tests-* gemset,
 523         # salting the gemset name so it doesn't interfere with
 524         # concurrent builds in other workspaces. Leave the choice of
 525         # ruby to the caller.
 526         gemset="arvados-tests-$(echo -n "${WORKSPACE}" | md5sum | head -c16)"
 527         rvm use "@${gemset}" --create \
 528             || fatal 'rvm gemset setup'
 529
 530         rvm env
 531         (bundle version | grep -q 2.2.19) || gem install --no-document bundler -v 2.2.19
 532         bundle="$(which bundle)"
 533         echo "$bundle"
 534         "$bundle" version | grep 2.2.19 || fatal 'install bundler'
 535     else
 536         # When our "bundle install"s need to install new gems to
 537         # satisfy dependencies, we want them to go where "gem install
 538         # --user-install" would put them. (However, if the caller has
 539         # already set GEM_HOME, we assume that's where dependencies
 540         # should be installed, and we should leave it alone.)
 541
 542         if [ -z "$GEM_HOME" ]; then
 543             user_gempath="$(gem env gempath)"
 544             export GEM_HOME="${user_gempath%%:*}"
 545         fi
 546         PATH="$(gem env gemdir)/bin:$PATH"
 547
 548         # When we build and install our own gems, we install them in our
 549         # $GEMHOME tmpdir, and we want them to be at the front of GEM_PATH and
 550         # PATH so integration tests prefer them over other versions that
 551         # happen to be installed in $user_gempath, system dirs, etc.
 552
 553         tmpdir_gem_home="$(env - PATH="$PATH" HOME="$GEMHOME" gem env gempath | cut -f1 -d:)"
 554         PATH="$tmpdir_gem_home/bin:$PATH"
 555         export GEM_PATH="$tmpdir_gem_home:$(gem env gempath)"
 556
 557         echo "Will install dependencies to $(gem env gemdir)"
 558         echo "Will install bundler and arvados gems to $tmpdir_gem_home"
 559         echo "Gem search path is GEM_PATH=$GEM_PATH"
 560         bundle="bundle"
 561         (
 562             export HOME=$GEMHOME
 563             versions=(2.2.19)
 564             for v in ${versions[@]}; do
 565                 if ! gem list --installed --version "${v}" bundler >/dev/null; then
 566                     gem install --no-document --user $(for v in ${versions[@]}; do echo bundler:${v}; done)
 567                     break
 568                 fi
 569             done
 570             "$bundle" version | tee /dev/stderr | grep -q 'version 2'
 571         ) || fatal 'install bundler'
 572         if test -d /var/lib/arvados-arvbox/ ; then
 573             # Inside arvbox, use bundler-installed binstubs.  The
 574             # system bundler and rail's own bin/bundle refuse to work.
 575             # I don't know why.
 576             bundle=binstubs/bundle
 577         fi
 578     fi
 579 }
 580
 581 with_test_gemset() {
 582     if [[ "$using_rvm" == true ]]; then
 583         "$@"
 584     else
 585         GEM_HOME="$tmpdir_gem_home" GEM_PATH="$tmpdir_gem_home" "$@"
 586     fi
 587 }
 588
 589 gem_uninstall_if_exists() {
 590     if gem list "$1\$" | egrep '^\w'; then
 591         gem uninstall --force --all --executables "$1"
 592     fi
 593 }
 594
 595 setup_virtualenv() {
 596     local venvdest="$1"; shift
 597     if ! [[ -e "$venvdest/bin/activate" ]] || ! [[ -e "$venvdest/bin/pip3" ]]; then
 598         python3 -m venv "$@" "$venvdest" || fatal "virtualenv $venvdest failed"
 599     elif [[ -n "$short" ]]; then
 600         return
 601     fi
 602     "$venvdest/bin/pip3" install --no-cache-dir 'setuptools>=18.5' 'pip>=7'
 603 }
 604
 605 initialize() {
 606     # If dependencies like ruby, go, etc. are installed in
 607     # /var/lib/arvados -- presumably by "arvados-server install" --
 608     # then we want to use those versions, instead of whatever happens
 609     # to be installed in /usr.
 610     PATH="/var/lib/arvados/bin:${PATH}"
 611     sanity_checks
 612
 613     echo "WORKSPACE=$WORKSPACE"
 614
 615     # Clean up .pyc files that may exist in the workspace
 616     cd "$WORKSPACE"
 617     find -name '*.pyc' -delete
 618
 619     if [[ -z "$temp" ]]; then
 620         temp="$(mktemp -d)"
 621     fi
 622
 623     # Set up temporary install dirs (unless existing dirs were supplied)
 624     for tmpdir in VENV3DIR GOPATH GEMHOME PERLINSTALLBASE R_LIBS
 625     do
 626         if [[ -z "${!tmpdir}" ]]; then
 627             eval "$tmpdir"="$temp/$tmpdir"
 628         fi
 629         if ! [[ -d "${!tmpdir}" ]]; then
 630             mkdir "${!tmpdir}" || fatal "can't create ${!tmpdir} (does $temp exist?)"
 631         fi
 632     done
 633
 634     rm -vf "${WORKSPACE}/tmp/*.log"
 635
 636     export PERLINSTALLBASE
 637     export PERL5LIB="$PERLINSTALLBASE/lib/perl5${PERL5LIB:+:$PERL5LIB}"
 638
 639     export R_LIBS
 640
 641     export GOPATH
 642     # Make sure our compiled binaries under test override anything
 643     # else that might be in the environment.
 644     export PATH=$GOPATH/bin:$PATH
 645
 646     # Jenkins config requires that glob tmp/*.log match something. Ensure
 647     # that happens even if we don't end up running services that set up
 648     # logging.
 649     mkdir -p "${WORKSPACE}/tmp/" || fatal "could not mkdir ${WORKSPACE}/tmp"
 650     touch "${WORKSPACE}/tmp/controller.log" || fatal "could not touch ${WORKSPACE}/tmp/controller.log"
 651
 652     unset http_proxy https_proxy no_proxy
 653
 654     # Note: this must be the last time we change PATH, otherwise rvm will
 655     # whine a lot.
 656     setup_ruby_environment
 657
 658     echo "PATH is $PATH"
 659 }
 660
 661 install_env() {
 662     go mod download || fatal "Go deps failed"
 663     which goimports >/dev/null || go install golang.org/x/tools/cmd/goimports@latest || fatal "Go setup failed"
 664
 665     setup_virtualenv "$VENV3DIR"
 666     . "$VENV3DIR/bin/activate"
 667
 668     # Needed for run_test_server.py which is used by certain (non-Python) tests.
 669     # pdoc3 needed to generate the Python SDK documentation.
 670     (
 671         set -e
 672         "${VENV3DIR}/bin/pip3" install wheel
 673         "${VENV3DIR}/bin/pip3" install PyYAML
 674         "${VENV3DIR}/bin/pip3" install httplib2
 675         "${VENV3DIR}/bin/pip3" install future
 676         "${VENV3DIR}/bin/pip3" install google-api-python-client
 677         "${VENV3DIR}/bin/pip3" install ciso8601
 678         "${VENV3DIR}/bin/pip3" install pycurl
 679         "${VENV3DIR}/bin/pip3" install ws4py
 680         "${VENV3DIR}/bin/pip3" install pdoc3
 681         cd "$WORKSPACE/sdk/python"
 682         python3 setup.py install
 683     ) || fatal "installing PyYAML and sdk/python failed"
 684 }
 685
 686 retry() {
 687     remain="${repeat}"
 688     while :
 689     do
 690         if ${@}; then
 691             if [[ "$remain" -gt 1 ]]; then
 692                 remain=$((${remain}-1))
 693                 title "(repeating ${remain} more times)"
 694             else
 695                 break
 696             fi
 697         elif [[ "$retry" == 1 ]]; then
 698             read -p 'Try again? [Y/n] ' x
 699             if [[ "$x" != "y" ]] && [[ "$x" != "" ]]
 700             then
 701                 break
 702             fi
 703         else
 704             break
 705         fi
 706     done
 707 }
 708
 709 do_test() {
 710     case "${1}" in
 711         apps/workbench_units | apps/workbench_functionals | apps/workbench_integration)
 712             suite=apps/workbench
 713             ;;
 714         *)
 715             suite="${1}"
 716             ;;
 717     esac
 718     if [[ -n "${skip[$suite]}" || \
 719               -n "${skip[$1]}" || \
 720               (${#only[@]} -ne 0 && ${only[$suite]} -eq 0 && ${only[$1]} -eq 0) ]]; then
 721         return 0
 722     fi
 723     case "${1}" in
 724         services/api)
 725             stop_services
 726             check_arvados_config "$1"
 727             ;;
 728         gofmt | doc | lib/cli | lib/cloud/azure | lib/cloud/ec2 | lib/cloud/cloudtest | lib/cmd | lib/dispatchcloud/sshexecutor | lib/dispatchcloud/worker)
 729             check_arvados_config "$1"
 730             # don't care whether services are running
 731             ;;
 732         *)
 733             check_arvados_config "$1"
 734             if ! start_services; then
 735                 checkexit 1 "$1 tests"
 736                 title "test $1 -- failed to start services"
 737                 return 1
 738             fi
 739             ;;
 740     esac
 741     retry do_test_once ${@}
 742 }
 743
 744 go_ldflags() {
 745     version=${ARVADOS_VERSION:-$(git log -n1 --format=%H)-dev}
 746     echo "-X git.arvados.org/arvados.git/lib/cmd.version=${version} -X main.version=${version} -s -w"
 747 }
 748
 749 do_test_once() {
 750     unset result
 751
 752     title "test $1"
 753     timer_reset
 754
 755     result=
 756     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 757     if ! . "$VENV3DIR/bin/activate"
 758     then
 759         result=1
 760     elif [[ "$2" == "go" ]]
 761     then
 762         covername="coverage-$(echo "$1" | sed -e 's/\//_/g')"
 763         coverflags=("-covermode=count" "-coverprofile=$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp")
 764         testflags=()
 765         if [[ "$1" == "cmd/arvados-package" ]]; then
 766             testflags+=("-timeout" "20m")
 767         fi
 768         # We do "go install" here to catch compilation errors
 769         # before trying "go test". Otherwise, coverage-reporting
 770         # mode makes Go show the wrong line numbers when reporting
 771         # compilation errors.
 772         go install -ldflags "$(go_ldflags)" "$WORKSPACE/$1" && \
 773             cd "$WORKSPACE/$1" && \
 774             if [[ -n "${testargs[$1]}" ]]
 775         then
 776             # "go test -check.vv giturl" doesn't work, but this
 777             # does:
 778             go test ${short:+-short} ${testflags[@]} ${testargs[$1]}
 779         else
 780             # The above form gets verbose even when testargs is
 781             # empty, so use this form in such cases:
 782             go test ${short:+-short} ${testflags[@]} ${coverflags[@]} "git.arvados.org/arvados.git/$1"
 783         fi
 784         result=${result:-$?}
 785         if [[ -f "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" ]]
 786         then
 787             go tool cover -html="$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp" -o "$WORKSPACE/tmp/$covername.html"
 788             rm "$WORKSPACE/tmp/.$covername.tmp"
 789         fi
 790         [[ $result = 0 ]] && gofmt -e -d *.go
 791     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 792     then
 793         tries=0
 794         cd "$WORKSPACE/$1" && while :
 795         do
 796             tries=$((${tries}+1))
 797             # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 798             # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 799             if [[ -e "${3}activate" ]]; then
 800                 . "${3}activate"
 801             fi
 802             python setup.py ${short:+--short-tests-only} test ${testargs[$1]}
 803             result=$?
 804             if [[ ${tries} < 3 && ${result} == 137 ]]
 805             then
 806                 printf '\n*****\n%s tests killed -- retrying\n*****\n\n' "$1"
 807                 continue
 808             else
 809                 break
 810             fi
 811         done
 812     elif [[ "$2" != "" ]]
 813     then
 814         "test_$2"
 815     else
 816         "test_$1"
 817     fi
 818     result=${result:-$?}
 819     checkexit $result "$1 tests"
 820     title "test $1 -- `timer`"
 821     return $result
 822 }
 823
 824 check_arvados_config() {
 825     if [[ "$1" = "env" ]] ; then
 826         return
 827     fi
 828     if [[ -z "$ARVADOS_CONFIG" ]] ; then
 829         # Create config file.  The run_test_server script requires PyYAML,
 830         # so virtualenv needs to be active.  Downstream steps like
 831         # workbench install which require a valid config.yml.
 832         if [[ ! -s "$VENV3DIR/bin/activate" ]] ; then
 833             install_env
 834         fi
 835         . "$VENV3DIR/bin/activate"
 836         cd "$WORKSPACE"
 837         eval $(python3 sdk/python/tests/run_test_server.py setup_config)
 838         deactivate
 839     fi
 840 }
 841
 842 do_install() {
 843     if [[ -n "${skip[install]}" || ( -n "${only_install}" && "${only_install}" != "${1}" && "${only_install}" != "${2}" ) ]]; then
 844         return 0
 845     fi
 846     check_arvados_config "$1"
 847     retry do_install_once ${@}
 848 }
 849
 850 do_install_once() {
 851     title "install $1"
 852     timer_reset
 853
 854     result=
 855     if which deactivate >/dev/null; then deactivate; fi
 856     if [[ "$1" != "env" ]] && ! . "$VENV3DIR/bin/activate"; then
 857         result=1
 858     elif [[ "$2" == "go" ]]
 859     then
 860         go install -ldflags "$(go_ldflags)" "$WORKSPACE/$1"
 861     elif [[ "$2" == "pip" ]]
 862     then
 863         # $3 can name a path directory for us to use, including trailing
 864         # slash; e.g., the bin/ subdirectory of a virtualenv.
 865
 866         # Need to change to a different directory after creating
 867         # the source dist package to avoid a pip bug.
 868         # see https://arvados.org/issues/5766 for details.
 869
 870         # Also need to install twice, because if it believes the package is
 871         # already installed, pip it won't install it.  So the first "pip
 872         # install" ensures that the dependencies are met, the second "pip
 873         # install" ensures that we've actually installed the local package
 874         # we just built.
 875         cd "$WORKSPACE/$1" \
 876             && "${3}python3" setup.py sdist rotate --keep=1 --match .tar.gz \
 877             && cd "$WORKSPACE" \
 878             && "${3}pip3" install --no-cache-dir "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz \
 879             && "${3}pip3" install --no-cache-dir --no-deps --ignore-installed "$WORKSPACE/$1/dist"/*.tar.gz
 880     elif [[ "$2" != "" ]]
 881     then
 882         "install_$2"
 883     else
 884         "install_$1"
 885     fi
 886     result=${result:-$?}
 887     checkexit $result "$1 install"
 888     title "install $1 -- `timer`"
 889     return $result
 890 }
 891
 892 bundle_install_trylocal() {
 893     (
 894         set -e
 895         echo "(Running bundle install --local. 'could not find package' messages are OK.)"
 896         if ! "$bundle" install --local --no-deployment; then
 897             echo "(Running bundle install again, without --local.)"
 898             "$bundle" install --no-deployment
 899         fi
 900         "$bundle" package
 901     )
 902 }
 903
 904 install_doc() {
 905     cd "$WORKSPACE/doc" \
 906         && bundle_install_trylocal \
 907         && rm -rf .site
 908 }
 909
 910 install_gem() {
 911     gemname=$1
 912     srcpath=$2
 913     with_test_gemset gem_uninstall_if_exists "$gemname" \
 914         && cd "$WORKSPACE/$srcpath" \
 915         && bundle_install_trylocal \
 916         && gem build "$gemname.gemspec" \
 917         && with_test_gemset gem install --no-document $(ls -t "$gemname"-*.gem|head -n1)
 918 }
 919
 920 install_sdk/ruby() {
 921     install_gem arvados sdk/ruby
 922 }
 923
 924 install_sdk/R() {
 925   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
 926     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
 927        && Rscript --vanilla install_deps.R
 928   fi
 929 }
 930
 931 install_sdk/perl() {
 932     cd "$WORKSPACE/sdk/perl" \
 933         && perl Makefile.PL INSTALL_BASE="$PERLINSTALLBASE" \
 934         && make install INSTALLDIRS=perl
 935 }
 936
 937 install_sdk/cli() {
 938     install_gem arvados-cli sdk/cli
 939 }
 940
 941 install_services/login-sync() {
 942     install_gem arvados-login-sync services/login-sync
 943 }
 944
 945 install_services/api() {
 946     stop_services
 947     check_arvados_config "services/api"
 948     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 949         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
 950             || return 1
 951
 952     rm -f config/environments/test.rb
 953     cp config/environments/test.rb.example config/environments/test.rb
 954
 955     # Clear out any lingering postgresql connections to the test
 956     # database, so that we can drop it. This assumes the current user
 957     # is a postgresql superuser.
 958     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 959         && test_database=$("${VENV3DIR}/bin/python3" -c "import yaml; print(yaml.safe_load(open('$ARVADOS_CONFIG','r'))['Clusters']['zzzzz']['PostgreSQL']['Connection']['dbname'])") \
 960         && psql "$test_database" -c "SELECT pg_terminate_backend (pg_stat_activity.pid::int) FROM pg_stat_activity WHERE pg_stat_activity.datname = '$test_database';" 2>/dev/null
 961
 962     mkdir -p "$WORKSPACE/services/api/tmp/pids"
 963
 964     cert="$WORKSPACE/services/api/tmp/self-signed"
 965     if [[ ! -e "$cert.pem" || "$(date -r "$cert.pem" +%s)" -lt 1512659226 ]]; then
 966         (
 967             dir="$WORKSPACE/services/api/tmp"
 968             set -e
 969             openssl req -newkey rsa:2048 -nodes -subj '/C=US/ST=State/L=City/CN=localhost' -out "$cert.csr" -keyout "$cert.key" </dev/null
 970             openssl x509 -req -in "$cert.csr" -signkey "$cert.key" -out "$cert.pem" -days 3650 -extfile <(printf 'subjectAltName=DNS:localhost,DNS:::1,DNS:0.0.0.0,DNS:127.0.0.1,IP:::1,IP:0.0.0.0,IP:127.0.0.1')
 971         ) || return 1
 972     fi
 973
 974     cd "$WORKSPACE/services/api" \
 975         && rm -rf tmp/git \
 976         && mkdir -p tmp/git \
 977         && cd tmp/git \
 978         && tar xf ../../test/test.git.tar \
 979         && mkdir -p internal.git \
 980         && git --git-dir internal.git init \
 981             || return 1
 982
 983     (
 984         set -ex
 985         cd "$WORKSPACE/services/api"
 986         export RAILS_ENV=test
 987         if bin/rails db:environment:set ; then
 988             bin/rake db:drop
 989         fi
 990         bin/rake db:setup
 991         bin/rake db:fixtures:load
 992     ) || return 1
 993 }
 994
 995 declare -a pythonstuff
 996 pythonstuff=(
 997     sdk/python:py3
 998     sdk/cwl:py3
 999     services/dockercleaner:py3
1000     services/fuse:py3
1001     tools/crunchstat-summary:py3
1002 )
1003
1004 declare -a gostuff
1005 gostuff=($(cd "$WORKSPACE" && git ls-files | grep '\.go$' | sed -e 's/\/[^\/]*$//' | sort -u))
1006
1007 install_apps/workbench() {
1008     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1009         && mkdir -p tmp/cache \
1010         && RAILS_ENV=test bundle_install_trylocal \
1011         && RAILS_ENV=test RAILS_GROUPS=assets "$bundle" exec rake npm:install
1012 }
1013
1014 test_doc() {
1015     (
1016         set -e
1017         cd "$WORKSPACE/doc"
1018         ARVADOS_API_HOST=pirca.arvadosapi.com
1019         # Make sure python-epydoc is installed or the next line won't
1020         # do much good!
1021         PYTHONPATH=$WORKSPACE/sdk/python/ "$bundle" exec rake linkchecker baseurl=file://$WORKSPACE/doc/.site/ arvados_workbench_host=https://workbench.$ARVADOS_API_HOST arvados_api_host=$ARVADOS_API_HOST
1022     )
1023 }
1024
1025 test_gofmt() {
1026     cd "$WORKSPACE" || return 1
1027     dirs=$(ls -d */ | egrep -v 'vendor|tmp')
1028     [[ -z "$(gofmt -e -d $dirs | tee -a /dev/stderr)" ]]
1029 }
1030
1031 test_services/api() {
1032     rm -f "$WORKSPACE/services/api/git-commit.version"
1033     cd "$WORKSPACE/services/api" \
1034         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake test TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[services/api]}
1035 }
1036
1037 test_sdk/ruby() {
1038     cd "$WORKSPACE/sdk/ruby" \
1039         && "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/ruby]}
1040 }
1041
1042 test_sdk/R() {
1043   if [[ "$NEED_SDK_R" = true ]]; then
1044     cd "$WORKSPACE/sdk/R" \
1045         && Rscript --vanilla run_test.R
1046   fi
1047 }
1048
1049 test_sdk/cli() {
1050     cd "$WORKSPACE/sdk/cli" \
1051         && mkdir -p /tmp/keep \
1052         && KEEP_LOCAL_STORE=/tmp/keep "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[sdk/cli]}
1053 }
1054
1055 test_sdk/java-v2() {
1056     cd "$WORKSPACE/sdk/java-v2" && gradle test ${testargs[sdk/java-v2]}
1057 }
1058
1059 test_services/login-sync() {
1060     cd "$WORKSPACE/services/login-sync" \
1061         && "$bundle" exec rake test TESTOPTS=-v ${testargs[services/login-sync]}
1062 }
1063
1064 test_apps/workbench_units() {
1065     local TASK="test:units"
1066     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1067         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_units]}
1068 }
1069
1070 test_apps/workbench_functionals() {
1071     local TASK="test:functionals"
1072     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1073         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_functionals]}
1074 }
1075
1076 test_apps/workbench_integration() {
1077     local TASK="test:integration"
1078     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1079         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} TESTOPTS=\'-v -d\' ${testargs[apps/workbench]} ${testargs[apps/workbench_integration]}
1080 }
1081
1082 test_apps/workbench_benchmark() {
1083     local TASK="test:benchmark"
1084     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1085         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_benchmark]}
1086 }
1087
1088 test_apps/workbench_profile() {
1089     local TASK="test:profile"
1090     cd "$WORKSPACE/apps/workbench" \
1091         && eval env RAILS_ENV=test ${short:+RAILS_TEST_SHORT=1} "$bundle" exec rake ${TASK} ${testargs[apps/workbench_profile]}
1092 }
1093
1094 install_deps() {
1095     # Install parts needed by test suites
1096     do_install env
1097     do_install cmd/arvados-server go
1098     do_install sdk/cli
1099     do_install sdk/perl
1100     do_install sdk/python pip "${VENV3DIR}/bin/"
1101     do_install sdk/ruby
1102     do_install services/api
1103     do_install services/keepproxy go
1104     do_install services/keep-web go
1105 }
1106
1107 install_all() {
1108     do_install env
1109     do_install doc
1110     do_install sdk/ruby
1111     do_install sdk/R
1112     do_install sdk/perl
1113     do_install sdk/cli
1114     do_install services/login-sync
1115     for p in "${pythonstuff[@]}"
1116     do
1117        dir=${p%:py3}
1118        if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1119            do_install ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1120        fi
1121     done
1122     for g in "${gostuff[@]}"
1123     do
1124         do_install "$g" go
1125     done
1126     do_install services/api
1127     do_install apps/workbench
1128 }
1129
1130 test_all() {
1131     stop_services
1132     do_test services/api
1133
1134     # Shortcut for when we're only running apiserver tests. This saves a bit of time,
1135     # because we don't need to start up the api server for subsequent tests.
1136     if [ ! -z "$only" ] && [ "$only" == "services/api" ]; then
1137         rotate_logfile "$WORKSPACE/services/api/log/" "test.log"
1138         exit_cleanly
1139     fi
1140
1141     do_test gofmt
1142     do_test doc
1143     do_test sdk/ruby
1144     do_test sdk/R
1145     do_test sdk/cli
1146     do_test services/login-sync
1147     do_test sdk/java-v2
1148     for p in "${pythonstuff[@]}"
1149     do
1150         dir=${p%:py3}
1151         if [[ -z ${skip[python3]} ]]; then
1152             do_test ${dir} pip "$VENV3DIR/bin/"
1153         fi
1154     done
1155
1156     for g in "${gostuff[@]}"
1157     do
1158         do_test "$g" go
1159     done
1160     do_test apps/workbench_units
1161     do_test apps/workbench_functionals
1162     do_test apps/workbench_integration
1163     do_test apps/workbench_benchmark
1164     do_test apps/workbench_profile
1165 }
1166
1167 test_go() {
1168     do_test gofmt
1169     for g in "${gostuff[@]}"
1170     do
1171         do_test "$g" go
1172     done
1173 }
1174
1175 help_interactive() {
1176     echo "== Interactive commands:"
1177     echo "TARGET                 (short for 'test DIR')"
1178     echo "test TARGET"
1179     echo "10 test TARGET         (run test 10 times)"
1180     echo "test TARGET:py3        (test with python3)"
1181     echo "test TARGET -check.vv  (pass arguments to test)"
1182     echo "install TARGET"
1183     echo "install env            (go/python libs)"
1184     echo "install deps           (go/python libs + arvados components needed for integration tests)"
1185     echo "reset                  (...services used by integration tests)"
1186     echo "exit"
1187     echo "== Test targets:"
1188     echo "${!testfuncargs[@]}" | tr ' ' '\n' | sort | column
1189 }
1190
1191 initialize
1192
1193 declare -A testfuncargs=()
1194 for g in "${gostuff[@]}"; do
1195     testfuncargs[$g]="$g go"
1196 done
1197 for p in "${pythonstuff[@]}"; do
1198     dir=${p%:py3}
1199     testfuncargs[$dir:py3]="$dir pip $VENV3DIR/bin/"
1200 done
1201
1202 testfuncargs["sdk/cli"]="sdk/cli"
1203 testfuncargs["sdk/R"]="sdk/R"
1204 testfuncargs["sdk/java-v2"]="sdk/java-v2"
1205 testfuncargs["apps/workbench_units"]="apps/workbench_units"
1206 testfuncargs["apps/workbench_functionals"]="apps/workbench_functionals"
1207 testfuncargs["apps/workbench_integration"]="apps/workbench_integration"
1208 testfuncargs["apps/workbench_benchmark"]="apps/workbench_benchmark"
1209 testfuncargs["apps/workbench_profile"]="apps/workbench_profile"
1210
1211 if [[ -z ${interactive} ]]; then
1212     install_all
1213     test_all
1214 else
1215     skip=()
1216     only=()
1217     only_install=()
1218     if [[ -e "$VENV3DIR/bin/activate" ]]; then stop_services; fi
1219     setnextcmd() {
1220         if [[ "$TERM" = dumb ]]; then
1221             # assume emacs, or something, is offering a history buffer
1222             # and pre-populating the command will only cause trouble
1223             nextcmd=
1224         elif [[ ! -e "$VENV3DIR/bin/activate" ]]; then
1225             nextcmd="install deps"
1226         else
1227             nextcmd=""
1228         fi
1229     }
1230     echo
1231     help_interactive
1232     nextcmd="install deps"
1233     setnextcmd
1234     HISTFILE="$WORKSPACE/tmp/.history"
1235     history -r
1236     ignore_sigint=1
1237     while read -p 'What next? ' -e -i "$nextcmd" nextcmd; do
1238         history -s "$nextcmd"
1239         history -w
1240         count=1
1241         if [[ "${nextcmd}" =~ ^[0-9] ]]; then
1242           read count nextcmd <<<"${nextcmd}"
1243         fi
1244         read verb target opts <<<"${nextcmd}"
1245         target="${target%/}"
1246         target="${target/\/:/:}"
1247         case "${verb}" in
1248             "exit" | "quit")
1249                 exit_cleanly
1250                 ;;
1251             "reset")
1252                 stop_services
1253                 ;;
1254             "test" | "install")
1255                 case "$target" in
1256                     "")
1257                         help_interactive
1258                         ;;
1259                     all | deps)
1260                         ${verb}_${target}
1261                         ;;
1262                     *)
1263                         argstarget=${target%:py3}
1264                         testargs["$argstarget"]="${opts}"
1265                         tt="${testfuncargs[${target}]}"
1266                         tt="${tt:-$target}"
1267                         while [ $count -gt 0 ]; do
1268                           do_$verb $tt
1269                           let "count=count-1"
1270                         done
1271                         ;;
1272                 esac
1273                 ;;
1274             "" | "help" | *)
1275                 help_interactive
1276                 ;;
1277         esac
1278         if [[ ${#successes[@]} -gt 0 || ${#failures[@]} -gt 0 ]]; then
1279             report_outcomes
1280             successes=()
1281             failures=()
1282         fi
1283         cd "$WORKSPACE"
1284         setnextcmd
1285     done
1286     echo
1287 fi
1288 exit_cleanly