scripts/upload-workflow

   1 #!/bin/sh
   2 set -e
   3 FILE=$1
   4 DIR=$(dirname $FILE)
   5 . $(dirname $0)/setup-env
   6 if test -s $DIR/defaults.yaml ; then
   7     DEFAULTS=$DIR/defaults.yaml
   8 fi
   9 if test -s $DIR/WORKFLOW_UUID ; then
  10   arvados-cwl-runner --update-workflow $(cat $DIR/WORKFLOW_UUID) $PROJECT_UUID $FILE $DEFAULTS
  11 else
  12   arvados-cwl-runner --create-workflow $PROJECT_UUID $FILE $DEFAULTS > $DIR/WORKFLOW_UUID
  13 fi