scripts/run-workflow

   1 #!/bin/sh
   2 set -e
   3 FILE=$1
   4 DIR=$(dirname $FILE)
   5 . $(dirname $0)/setup-env
   6 FILEBASE=$(basename "$FILE" .cwl)
   7 if test -s $DIR/${FILEBASE}-input.yaml ; then
   8     INPUT=$DIR/${FILEBASE}-input.yaml
   9 fi
  10 arvados-cwl-runner $PROJECT_UUID $FILE $INPUT