Rearranging for clarity
[arvados-tutorial.git] / docker / bwa / Dockerfile
diff --git a/docker/bwa/Dockerfile b/docker/bwa/Dockerfile
deleted file mode 100644 (file)
index 27a6254..0000000
+++ /dev/null
@@ -1,25 +0,0 @@
-FROM arvados/jobs
-MAINTAINER Bryan Cosca <bcosca@curii.com>
-
-USER root
-
-RUN apt-get update -qy
-RUN apt-get install -qy build-essential wget cmake zlib1g-dev python-pip unzip libbz2-dev liblzma-dev libcurl4-openssl-dev libncurses-dev
-
-RUN mkdir -p /usr/share/man/man1
-RUN apt-get install -qy default-jdk
-
-ADD bwa-0.7.17.tar.bz2 /
-WORKDIR bwa-0.7.17
-RUN make
-
-ADD samtools-1.10.tar.bz2 /
-WORKDIR /samtools-1.10
-RUN ./configure && make && make install
-
-ADD picard.jar /
-
-WORKDIR /
-
-# ADD bcftools-1.10.2.tar.bz2 /
-