WGS-processing/docker/fastqc/Dockerfile

   1 FROM arvados/jobs
   2 MAINTAINER Bryan Cosca <bcosca@curii.com>
   3
   4 USER root
   5
   6 RUN apt-get update -qy
   7 RUN apt-get install -qy build-essential wget cmake zlib1g-dev python-pip unzip libbz2-dev liblzma-dev libcurl4-openssl-dev libncurses-dev
   8
   9 RUN mkdir -p /usr/share/man/man1
  10 RUN apt-get install -qy default-jdk
  11
  12 ADD fastqc_v0.11.9.zip /
  13 RUN unzip fastqc_v0.11.9.zip
  14
  15 WORKDIR /
  16