WGS-processing/docker/fastqc/Dockerfile

   1 FROM arvados/jobs:latest
   2 USER root
   3 MAINTAINER Sarah Wait Zaranek <swz@curii.com>
   4
   5 RUN apt-get update -qy
   6 RUN apt-get install -qy build-essential wget cmake zlib1g-dev python-pip unzip libbz2-dev liblzma-dev libcurl4-openssl-dev libncurses-dev
   7
   8 RUN mkdir -p /usr/share/man/man1
   9 RUN apt-get install -qy default-jdk
  10
  11 ADD fastqc_v0.11.9.zip /
  12 RUN unzip fastqc_v0.11.9.zip
  13
  14 WORKDIR /
  15